273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0592 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0592  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 343 aa  681    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.641435  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1497  condensin subunit ScpB  36.31 
 
 		 367 aa  226  3e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000476925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0594  condensin subunit ScpB  35.62 
 
 		 371 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1099  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.89 
 
 		 165 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0366895  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0521  chromosome segregation and condensation protein ScpB  34.67 
 
 		 192 aa  95.1  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0308  chromosome segregation and condensation protein ScpB  34.21 
 
 		 191 aa  94  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09921  transcription regulator  32.08 
 
 		 160 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2413  condensin subunit ScpB  33.33 
 
 		 177 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000581218  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3666  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.65 
 
 		 160 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1105  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.21 
 
 		 157 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1132  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.21 
 
 		 157 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000469648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0891  condensin subunit ScpB  30.82 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1880  condensin subunit ScpB  34.27 
 
 		 173 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.379678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1721  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.21 
 
 		 164 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000287131  hitchhiker  0.000910071 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1067  putative transcriptional regulator  33.57 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.714115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  36.6 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  36.6 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.6 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0426  condensin subunit ScpB  32.68 
 
 		 183 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  34.42 
 
 		 195 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1432  condensin subunit ScpB  31.47 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  34.5 
 
 		 201 aa  75.5  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  33.33 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0298  condensin subunit ScpB  29.66 
 
 		 168 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09701  transcription regulator  29.66 
 
 		 168 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0684332  normal  0.14111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  32.69 
 
 		 181 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  29.94 
 
 		 168 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08501  transcription regulator  28.77 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152979  hitchhiker  0.00163569 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  34.21 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  32.89 
 
 		 171 aa  72.4  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15391  transcription regulator  30.14 
 
 		 177 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  36.08 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.26 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35 
 
 		 193 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.22 
 
 		 176 aa  69.3  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  31 
 
 		 269 aa  67  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  34.72 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  29.19 
 
 		 198 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  32.03 
 
 		 195 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  36.36 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.59 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  32.05 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  25.95 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.9 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.36 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1027  putative segregation and condensation protein B  26.77 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.61 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  30.77 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  34.42 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  26.62 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  34.42 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  32.69 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  29.68 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  29.68 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  31.58 
 
 		 193 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  29.82 
 
 		 195 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  28.3 
 
 		 209 aa  62  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.92 
 
 		 190 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  30.43 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  28.93 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  35.44 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  28.3 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  32.72 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.03 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  26.45 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  27.74 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.19 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  32.28 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  30.52 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  29.14 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  28.93 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  28.93 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  30.97 
 
 		 264 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  27.5 
 
 		 193 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.75 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  28.25 
 
 		 198 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  28.48 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  29.75 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  29.75 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  28.49 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  27.5 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  28.76 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  30.72 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  28.85 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  33.77 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  31.25 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  30.38 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.33 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  25.97 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  28.49 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  28.49 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.61 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.94 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  28.49 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.61 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  32.67 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  30.13 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  29.3 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>