276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1099 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1099  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 
165 aa  327  5.0000000000000004e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0366895  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1497  condensin subunit ScpB  41.83 
 
 
367 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000476925  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0592  putative transcriptional regulator  41.89 
 
 
343 aa  125  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.641435  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0594  condensin subunit ScpB  37.01 
 
 
371 aa  105  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1880  condensin subunit ScpB  32.93 
 
 
173 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.379678  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0308  chromosome segregation and condensation protein ScpB  34.72 
 
 
191 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2413  condensin subunit ScpB  35.42 
 
 
177 aa  88.2  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000581218  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3666  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.03 
 
 
160 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1721  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.33 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000287131  hitchhiker  0.000910071 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  32.16 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1105  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.33 
 
 
157 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0521  chromosome segregation and condensation protein ScpB  35.19 
 
 
192 aa  84  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1132  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.64 
 
 
157 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000469648  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09921  transcription regulator  29.63 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  31.68 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  36.36 
 
 
282 aa  78.6  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  33.78 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  29.11 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1432  condensin subunit ScpB  30.77 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  28.48 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08501  transcription regulator  34.03 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152979  hitchhiker  0.00163569 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  28.66 
 
 
211 aa  70.9  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0426  condensin subunit ScpB  28.37 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15391  transcription regulator  30.07 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  27.85 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.08 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.8 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1067  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.714115  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0891  condensin subunit ScpB  26.87 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09701  transcription regulator  29.37 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0684332  normal  0.14111 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  30.38 
 
 
226 aa  67.8  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  27.1 
 
 
229 aa  67.8  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.45 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.75 
 
 
197 aa  67  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0298  condensin subunit ScpB  28.67 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.8 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  30.06 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  28.48 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  30.72 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  30.07 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  29.45 
 
 
387 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  29.52 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  31.82 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1955  putative transcriptional regulator  25.83 
 
 
219 aa  64.3  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  27.45 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.61 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.29 
 
 
225 aa  63.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  29.33 
 
 
189 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  29.61 
 
 
205 aa  63.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  29.61 
 
 
212 aa  62.8  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  29.53 
 
 
251 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  29.35 
 
 
206 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.99 
 
 
193 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  28.1 
 
 
299 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  26.9 
 
 
239 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  26.83 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  31.29 
 
 
198 aa  62.4  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  28.66 
 
 
213 aa  62  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  27.1 
 
 
254 aa  61.6  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  27.1 
 
 
247 aa  61.6  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.11 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.46 
 
 
192 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.76 
 
 
220 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 
243 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  28.66 
 
 
201 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  25.85 
 
 
254 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2319  putative transcriptional regulator  28.1 
 
 
211 aa  59.7  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.62874  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1752  putative transcriptional regulator  25.17 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178756  normal  0.0679167 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  28.22 
 
 
352 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.53 
 
 
190 aa  59.7  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  26.49 
 
 
385 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  28.21 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  27.33 
 
 
195 aa  58.9  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1570  condensin subunit ScpB  25.17 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.343062  normal  0.779197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  28.19 
 
 
241 aa  58.9  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  28.1 
 
 
190 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  28.25 
 
 
226 aa  58.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  27.03 
 
 
206 aa  58.5  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  27.95 
 
 
399 aa  58.5  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.3 
 
 
200 aa  58.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  26.99 
 
 
253 aa  58.5  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  28.39 
 
 
304 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  30.38 
 
 
198 aa  58.2  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  28.95 
 
 
192 aa  58.2  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.58 
 
 
269 aa  58.2  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  28.03 
 
 
198 aa  58.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  28.03 
 
 
198 aa  58.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  28.03 
 
 
198 aa  58.2  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  28.76 
 
 
238 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  24.34 
 
 
231 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.1 
 
 
254 aa  57.8  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  29.11 
 
 
198 aa  57.8  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.03 
 
 
389 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  22.82 
 
 
284 aa  57.4  0.00000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.76 
 
 
228 aa  57.4  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  27.81 
 
 
242 aa  57.4  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  27.27 
 
 
442 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 
242 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  26.32 
 
 
302 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.401895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>