86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_08501 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_08501  transcription regulator  100 
 
 		 179 aa  360  7.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152979  hitchhiker  0.00163569 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15391  transcription regulator  73.96 
 
 		 177 aa  258  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09701  transcription regulator  67.9 
 
 		 168 aa  228  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0684332  normal  0.14111 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0298  condensin subunit ScpB  67.9 
 
 		 168 aa  228  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1432  condensin subunit ScpB  63.98 
 
 		 165 aa  219  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1067  putative transcriptional regulator  60.25 
 
 		 165 aa  207  8e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.714115  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0426  condensin subunit ScpB  53.06 
 
 		 183 aa  167  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1721  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.61 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000287131  hitchhiker  0.000910071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3666  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.99 
 
 		 160 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09921  transcription regulator  49.66 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1105  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.5 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0308  chromosome segregation and condensation protein ScpB  45.73 
 
 		 191 aa  154  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1132  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.86 
 
 		 157 aa  154  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000469648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1880  condensin subunit ScpB  49.32 
 
 		 173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.379678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2413  condensin subunit ScpB  47.1 
 
 		 177 aa  145  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000581218  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0891  condensin subunit ScpB  47.14 
 
 		 154 aa  144  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09521  hypothetical protein  55.42 
 
 		 85 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.522022  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09501  hypothetical protein  55.42 
 
 		 85 aa  98.2  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.781091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0594  condensin subunit ScpB  34.97 
 
 		 371 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1497  condensin subunit ScpB  31.47 
 
 		 367 aa  87.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000476925  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0592  putative transcriptional regulator  28.77 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.641435  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1099  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.03 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0366895  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0521  chromosome segregation and condensation protein ScpB  33.33 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  29.03 
 
 		 195 aa  62  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  28.89 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1166  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.28 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  25.85 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  22.15 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  30.72 
 
 		 256 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  30.46 
 
 		 332 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.4 
 
 		 196 aa  51.2  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  25.68 
 
 		 372 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.68 
 
 		 387 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  30.26 
 
 		 277 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  30.07 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  24.55 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  29.8 
 
 		 330 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  30.72 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  25 
 
 		 387 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  29.14 
 
 		 263 aa  49.3  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  32.54 
 
 		 257 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  32.54 
 
 		 255 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  28.65 
 
 		 337 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  24 
 
 		 282 aa  48.5  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  28.75 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  29.93 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.27 
 
 		 189 aa  47.8  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  27.67 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  22.56 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  24.2 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  28.97 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  22.56 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  22.82 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  25.32 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  23.31 
 
 		 243 aa  45.1  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  23.88 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  25.48 
 
 		 222 aa  45.1  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  27.48 
 
 		 181 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  26.59 
 
 		 250 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.11 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  23.29 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.95 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  25.85 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  25.93 
 
 		 228 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  27.21 
 
 		 198 aa  42  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  20.86 
 
 		 191 aa  42  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  28.95 
 
 		 264 aa  42  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  22.97 
 
 		 352 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  21.88 
 
 		 231 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  26.9 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  25.32 
 
 		 192 aa  41.6  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  26.83 
 
 		 198 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  27.21 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  27.21 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  27.21 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  23.12 
 
 		 237 aa  41.2  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  26.83 
 
 		 198 aa  41.2  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  21.88 
 
 		 243 aa  41.2  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  22.97 
 
 		 229 aa  41.2  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  26.83 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  26.83 
 
 		 198 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  26.83 
 
 		 198 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.83 
 
 		 198 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.26 
 
 		 179 aa  41.2  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2137  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.14 
 
 		 173 aa  40.8  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.232233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>