234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1721 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1721  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 
164 aa  335  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000287131  hitchhiker  0.000910071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3666  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  66.45 
 
 
160 aa  224  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0308  chromosome segregation and condensation protein ScpB  63.52 
 
 
191 aa  218  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0426  condensin subunit ScpB  65.56 
 
 
183 aa  218  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2413  condensin subunit ScpB  66.89 
 
 
177 aa  216  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000581218  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1880  condensin subunit ScpB  62.09 
 
 
173 aa  212  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.379678  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1132  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  63.4 
 
 
157 aa  211  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000469648  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1105  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  62.75 
 
 
157 aa  211  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1432  condensin subunit ScpB  56.21 
 
 
165 aa  170  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09701  transcription regulator  53.95 
 
 
168 aa  167  7e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0684332  normal  0.14111 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0298  condensin subunit ScpB  53.29 
 
 
168 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1067  putative transcriptional regulator  52.29 
 
 
165 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.714115  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08501  transcription regulator  51.61 
 
 
179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152979  hitchhiker  0.00163569 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15391  transcription regulator  51.33 
 
 
177 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09921  transcription regulator  42.95 
 
 
160 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0891  condensin subunit ScpB  42.07 
 
 
154 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0594  condensin subunit ScpB  37.59 
 
 
371 aa  104  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1497  condensin subunit ScpB  31.72 
 
 
367 aa  98.6  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000476925  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09521  hypothetical protein  56.06 
 
 
85 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.522022  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09501  hypothetical protein  56.06 
 
 
85 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.781091  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1099  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.33 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0366895  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0592  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 
343 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.641435  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1166  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.93 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  29.19 
 
 
195 aa  67  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.87 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0521  chromosome segregation and condensation protein ScpB  31.76 
 
 
192 aa  63.9  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.22 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  26.58 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  28.57 
 
 
372 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  33.33 
 
 
239 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  28.57 
 
 
387 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  26.11 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.57 
 
 
387 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  27.63 
 
 
299 aa  62.4  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1955  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 
219 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  28.74 
 
 
238 aa  61.2  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  25.16 
 
 
243 aa  60.5  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  34.34 
 
 
332 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 
330 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  30.86 
 
 
201 aa  59.7  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  25.48 
 
 
195 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  27.74 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 
198 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  31.1 
 
 
198 aa  59.3  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.09 
 
 
176 aa  58.9  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  29.46 
 
 
284 aa  58.9  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  24.84 
 
 
195 aa  58.9  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  30.81 
 
 
198 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  30.81 
 
 
198 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  30.81 
 
 
198 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  30.13 
 
 
352 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  30.57 
 
 
211 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  29.58 
 
 
185 aa  58.2  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  32.47 
 
 
221 aa  57.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  25.32 
 
 
205 aa  57.4  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  26.47 
 
 
201 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.86 
 
 
281 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  31.33 
 
 
259 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  24.36 
 
 
179 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  25 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  29.3 
 
 
206 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  30.3 
 
 
194 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  32.72 
 
 
236 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.75 
 
 
193 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  29.34 
 
 
222 aa  55.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1752  putative transcriptional regulator  26.25 
 
 
186 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178756  normal  0.0679167 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  25.79 
 
 
282 aa  55.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 
245 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.32 
 
 
205 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  26.99 
 
 
193 aa  55.1  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  26.99 
 
 
193 aa  55.1  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.3 
 
 
192 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  27.39 
 
 
195 aa  54.7  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  30.18 
 
 
234 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  29.65 
 
 
198 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  28.3 
 
 
181 aa  54.7  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  29.65 
 
 
198 aa  54.7  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  29.94 
 
 
210 aa  54.7  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  29.65 
 
 
198 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.65 
 
 
198 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  29.65 
 
 
198 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  31.13 
 
 
221 aa  54.7  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.18 
 
 
234 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1570  condensin subunit ScpB  25.31 
 
 
183 aa  54.3  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.343062  normal  0.779197 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  27.39 
 
 
198 aa  54.3  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  27.16 
 
 
199 aa  53.9  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1016  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.16 
 
 
194 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  25.64 
 
 
195 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  29.69 
 
 
353 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  28.38 
 
 
196 aa  53.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  22.97 
 
 
198 aa  52.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  28 
 
 
253 aa  52.4  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.9 
 
 
197 aa  52.4  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  23.49 
 
 
202 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.89 
 
 
389 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  32.09 
 
 
210 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  25.47 
 
 
193 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  29.3 
 
 
211 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.05 
 
 
534 aa  52  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2313  putative transcriptional regulator  30.54 
 
 
230 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>