263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0594 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0594  condensin subunit ScpB  100 
 
 		 371 aa  746    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1497  condensin subunit ScpB  56.06 
 
 		 367 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000476925  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0592  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 		 343 aa  218  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.641435  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0308  chromosome segregation and condensation protein ScpB  39.75 
 
 		 191 aa  113  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1432  condensin subunit ScpB  41.84 
 
 		 165 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1099  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.01 
 
 		 165 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0366895  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1721  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.59 
 
 		 164 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000287131  hitchhiker  0.000910071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2413  condensin subunit ScpB  37.24 
 
 		 177 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000581218  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1067  putative transcriptional regulator  40.43 
 
 		 165 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.714115  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09921  transcription regulator  36.36 
 
 		 160 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0521  chromosome segregation and condensation protein ScpB  34.76 
 
 		 192 aa  99  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0426  condensin subunit ScpB  36.17 
 
 		 183 aa  96.3  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0891  condensin subunit ScpB  37.04 
 
 		 154 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15391  transcription regulator  36.36 
 
 		 177 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09701  transcription regulator  35.66 
 
 		 168 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0684332  normal  0.14111 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0298  condensin subunit ScpB  35.66 
 
 		 168 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3666  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.59 
 
 		 160 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1105  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.88 
 
 		 157 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1132  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.17 
 
 		 157 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000469648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08501  transcription regulator  34.97 
 
 		 179 aa  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152979  hitchhiker  0.00163569 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1880  condensin subunit ScpB  34.27 
 
 		 173 aa  89.7  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.379678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  34.87 
 
 		 198 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.92 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  33.33 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  32.03 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1027  putative segregation and condensation protein B  26.56 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  32.67 
 
 		 195 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0298  hypothetical protein  25.91 
 
 		 188 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  32.24 
 
 		 224 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  30.22 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  31.41 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  30.22 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  33.54 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.17 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.43 
 
 		 200 aa  67  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.95 
 
 		 196 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1616  hypothetical protein  25.91 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  31.52 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  31.13 
 
 		 183 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  33.96 
 
 		 210 aa  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  29.87 
 
 		 256 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  34.76 
 
 		 214 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  29.94 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  29.94 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  35 
 
 		 236 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  33.54 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  29.87 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.26 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2137  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.82 
 
 		 173 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  31.01 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  30 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09521  hypothetical protein  47.83 
 
 		 85 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.522022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  33.33 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.2 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.52 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1012  hypothetical protein  25.91 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  29.3 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  29.87 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  29.33 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09501  hypothetical protein  47.83 
 
 		 85 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.781091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.41 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  31.01 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  32.69 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  33.11 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  30.46 
 
 		 171 aa  62.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  29.19 
 
 		 194 aa  62.4  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  30.57 
 
 		 332 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  31.67 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1551  putative transcriptional regulator  33.11 
 
 		 180 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  30.38 
 
 		 206 aa  62.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  30.46 
 
 		 206 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  30.72 
 
 		 195 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  30.72 
 
 		 195 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  30.97 
 
 		 194 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  30.57 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  29.27 
 
 		 205 aa  62.4  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1582  segregation and condensation protein B  33.11 
 
 		 180 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  29.94 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  32.47 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  30.25 
 
 		 215 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  32.47 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  32.47 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  30.38 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  32.47 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  32.47 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  32.47 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  32.41 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  28.67 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  29.11 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  30.94 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  30.94 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  30.94 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  30.94 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  27.5 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  30.94 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  27.22 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  32.03 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>