141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2413 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2413  condensin subunit ScpB  100 
 
 		 177 aa  360  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000581218  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0308  chromosome segregation and condensation protein ScpB  81.98 
 
 		 191 aa  290  8e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3666  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  71.43 
 
 		 160 aa  224  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1880  condensin subunit ScpB  66.67 
 
 		 173 aa  219  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.379678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1721  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  66.89 
 
 		 164 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000287131  hitchhiker  0.000910071 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1132  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  69.54 
 
 		 157 aa  213  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000469648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1105  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  68.87 
 
 		 157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0426  condensin subunit ScpB  59.21 
 
 		 183 aa  189  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1432  condensin subunit ScpB  54.48 
 
 		 165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1067  putative transcriptional regulator  51.72 
 
 		 165 aa  157  6e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.714115  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0298  condensin subunit ScpB  49.06 
 
 		 168 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09701  transcription regulator  50 
 
 		 168 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0684332  normal  0.14111 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08501  transcription regulator  47.1 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152979  hitchhiker  0.00163569 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15391  transcription regulator  47.22 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09921  transcription regulator  41.1 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0891  condensin subunit ScpB  39.61 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0594  condensin subunit ScpB  37.24 
 
 		 371 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1497  condensin subunit ScpB  31.72 
 
 		 367 aa  90.9  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000476925  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0592  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 343 aa  89.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.641435  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1099  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.42 
 
 		 165 aa  88.2  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0366895  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09521  hypothetical protein  48.75 
 
 		 85 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.522022  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09501  hypothetical protein  48.75 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.781091  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0521  chromosome segregation and condensation protein ScpB  34.62 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  30.67 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  27.81 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  26.97 
 
 		 299 aa  61.6  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.68 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1955  putative transcriptional regulator  27.1 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  28.48 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  30.46 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  26.02 
 
 		 243 aa  57.8  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  29.94 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  28.95 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.36 
 
 		 228 aa  54.3  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  24.38 
 
 		 282 aa  54.3  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  24.68 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  27.15 
 
 		 211 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 238 aa  53.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  28.66 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  32.08 
 
 		 330 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  26.32 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  27.15 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  27.42 
 
 		 284 aa  53.9  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  23.49 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.81 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.81 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  24.49 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  32.08 
 
 		 332 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  24.84 
 
 		 387 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  28.48 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  24.32 
 
 		 198 aa  52.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  28.48 
 
 		 229 aa  52.4  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  27.33 
 
 		 226 aa  52  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  24.84 
 
 		 372 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  24.84 
 
 		 387 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  29.3 
 
 		 239 aa  51.6  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  25.81 
 
 		 181 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  28.19 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  31.62 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  30.57 
 
 		 287 aa  50.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  31.62 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  31.62 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  31.62 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  27.56 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1570  condensin subunit ScpB  25.31 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.343062  normal  0.779197 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  28.95 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  26.58 
 
 		 193 aa  48.5  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  24.19 
 
 		 269 aa  48.5  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1591  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  22.7 
 
 		 200 aa  48.5  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.91 
 
 		 198 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  24.82 
 
 		 205 aa  48.1  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 198 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 198 aa  48.1  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 198 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 198 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  29.73 
 
 		 221 aa  48.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  25.17 
 
 		 243 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  27.85 
 
 		 257 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1166  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.27 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  25.49 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  25.49 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  24.85 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  27.85 
 
 		 255 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  27.67 
 
 		 259 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  27.85 
 
 		 277 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  27.85 
 
 		 255 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  25.95 
 
 		 352 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  24.18 
 
 		 352 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  27.39 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  25.66 
 
 		 228 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  29.19 
 
 		 199 aa  45.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  28.48 
 
 		 236 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.19 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  27.95 
 
 		 256 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.51 
 
 		 281 aa  45.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  28.03 
 
 		 226 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.44 
 
 		 273 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>