139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1463 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1463  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  382  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1302  putative transcriptional regulator  51.53 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.941912  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0426  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0441  segregation and condensation protein B  36.36 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.54 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.61 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  22.22 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  25.52 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  31.79 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  23.87 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  29.93 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  27.89 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.67 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  32.1 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  28.57 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  24.24 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  27.87 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  27.27 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.08 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  22.22 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  31.48 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0350  chromosome segregation and condensation protein ScpB  30.71 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  25.17 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  30.81 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.46 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  28.19 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  27.92 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  27.27 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  25.61 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.81 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.54 
 
 		 534 aa  61.2  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.05 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.7 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  28.86 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  31.29 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  27.33 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  25.66 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.1 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  26.67 
 
 		 372 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  27.33 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.67 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.28 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  20.17 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  26 
 
 		 387 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7248  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.51 
 
 		 447 aa  58.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000483064  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  26.32 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0594  condensin subunit ScpB  28.17 
 
 		 371 aa  57.8  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  21.95 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  26.67 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  26.67 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  26.67 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  26.67 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  30.7 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  27.52 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  24.67 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  30.19 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  26.67 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  27.6 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  24.81 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  23.65 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0592  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.641435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  19.71 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  21.54 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  26.53 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  25.83 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  25.93 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  29.73 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  25.93 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  25.93 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  24.36 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  25.6 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.2 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  24.34 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  22.73 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  27.21 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  22.03 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  25.85 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  26.53 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  22.6 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  25.5 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09921  transcription regulator  28.03 
 
 		 160 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  27.92 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  22.92 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  22.83 
 
 		 253 aa  53.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.68 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  24.34 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  25.28 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0353  segregation and condensation protein B  23.33 
 
 		 388 aa  52  0.000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.260202  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1497  condensin subunit ScpB  22.6 
 
 		 367 aa  51.6  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000476925  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  24.22 
 
 		 279 aa  51.6  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  23.23 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  24.6 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf011  segregation and condensation protein B  24.69 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.57 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 		 241 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  29.31 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  22.73 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>