More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0707 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0707  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 279 aa  551  1e-156  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0318  porphobilinogen deaminase  51.79 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  44.53 
 
 		 314 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  44.53 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0262  porphobilinogen deaminase  39.76 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.207863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  43.08 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  40.64 
 
 		 315 aa  188  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0549  Hydroxymethylbilane synthase  40.33 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  0.484278 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  40.15 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4439  porphobilinogen deaminase  39.09 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  37.96 
 
 		 305 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0975  porphobilinogen deaminase  42.51 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  40.4 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  40.32 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  42.34 
 
 		 311 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  40.16 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36050  hydroxymethylbilane synthase  34.78 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000727024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  38.89 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  40.56 
 
 		 318 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2527  porphobilinogen deaminase  38.65 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.464027  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1702  porphobilinogen deaminase  41.43 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  39.34 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8325  porphobilinogen deaminase  38.21 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  40.94 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  37.85 
 
 		 358 aa  179  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02860  porphobilinogen deaminase  40.65 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.302767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1688  porphobilinogen deaminase  41.02 
 
 		 291 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.814141  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  39.13 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1838  porphobilinogen deaminase  39.68 
 
 		 305 aa  178  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  41.11 
 
 		 310 aa  178  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  40.4 
 
 		 308 aa  178  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0354  porphobilinogen deaminase  39.11 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  40.16 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  41.63 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  42.17 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  39.13 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1422  porphobilinogen deaminase  40.68 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.168494  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  39.29 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1198  porphobilinogen deaminase  40.49 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  39.53 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  39.42 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0491  porphobilinogen deaminase  40.89 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  38.78 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  37.15 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  38.74 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  38.74 
 
 		 314 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  38.74 
 
 		 314 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  36.9 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  38.31 
 
 		 310 aa  175  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  39.29 
 
 		 318 aa  175  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  38.65 
 
 		 317 aa  175  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  37.2 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  39.04 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  38.34 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  37.2 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1277  porphobilinogen deaminase  38.96 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000211617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  39.68 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  37.05 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  39.76 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  39.84 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  41.83 
 
 		 309 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  41.83 
 
 		 309 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2791  porphobilinogen deaminase  38.62 
 
 		 309 aa  173  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  38.34 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  39.76 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  39.76 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  39.76 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  38.98 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  38.34 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  37.94 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  39.04 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  39.04 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2660  porphobilinogen deaminase  38.21 
 
 		 309 aa  172  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  39.37 
 
 		 310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  41.83 
 
 		 309 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  38.98 
 
 		 310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  38.98 
 
 		 310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  38.98 
 
 		 310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  45.73 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  42.23 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  37.65 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  41.94 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1385  porphobilinogen deaminase  40.32 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  41.83 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  39.92 
 
 		 317 aa  172  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0649  porphobilinogen deaminase  39.92 
 
 		 307 aa  171  9e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.485602  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2966  porphobilinogen deaminase  38.55 
 
 		 330 aa  171  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4371  porphobilinogen deaminase  37.3 
 
 		 335 aa  171  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  39.43 
 
 		 308 aa  171  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0570  porphobilinogen deaminase  39.92 
 
 		 307 aa  171  9e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  38.34 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  41.13 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5394  porphobilinogen deaminase  37.75 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0767  porphobilinogen deaminase  39.36 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  41.43 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  38.1 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  38.74 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  41.04 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  39.61 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  37.5 
 
 		 316 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>