More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2660 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl2660  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 309 aa  631  1e-180  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2791  porphobilinogen deaminase  98.38 
 
 		 309 aa  622  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  52.12 
 
 		 313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  50.81 
 
 		 313 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 318 aa  300  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 313 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 313 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 320 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  49.51 
 
 		 313 aa  298  7e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  49.51 
 
 		 313 aa  298  7e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  49.51 
 
 		 310 aa  296  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  49.51 
 
 		 322 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  47.3 
 
 		 321 aa  293  3e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  49.19 
 
 		 309 aa  292  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  48.85 
 
 		 311 aa  291  7e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  49.51 
 
 		 313 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  49.51 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  47.56 
 
 		 313 aa  290  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  48.86 
 
 		 326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  48.53 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  49.51 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  48.53 
 
 		 309 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  48.86 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  46.43 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  47.56 
 
 		 313 aa  286  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  49.19 
 
 		 315 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0061  porphobilinogen deaminase  47.7 
 
 		 311 aa  285  9e-76  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  47.88 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  48.68 
 
 		 314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  46.58 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  48.53 
 
 		 313 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  46.77 
 
 		 317 aa  280  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  47.88 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  47.23 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  47.23 
 
 		 313 aa  279  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  47.88 
 
 		 313 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  47.23 
 
 		 313 aa  279  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  45.99 
 
 		 339 aa  279  4e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  48.21 
 
 		 317 aa  279  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  47.37 
 
 		 308 aa  278  7e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  47.23 
 
 		 313 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0089  hydroxymethylbilane synthase  45.76 
 
 		 345 aa  277  1e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  45.28 
 
 		 308 aa  277  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  47.68 
 
 		 312 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  47.23 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  46.91 
 
 		 313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  46.77 
 
 		 310 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  46.67 
 
 		 314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  47.35 
 
 		 312 aa  272  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  47.56 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0098  porphobilinogen deaminase  45.15 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  44.63 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  46.67 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  46.67 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  46.91 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  46.91 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  46.91 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  47.23 
 
 		 313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  46.91 
 
 		 310 aa  269  4e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  46.91 
 
 		 310 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  46.91 
 
 		 310 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  46.36 
 
 		 312 aa  268  8e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  47.35 
 
 		 311 aa  268  8e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  44.95 
 
 		 351 aa  267  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  46.58 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  46.69 
 
 		 326 aa  267  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  46.58 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  46.25 
 
 		 310 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  45.42 
 
 		 319 aa  265  7e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  43.71 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  45.39 
 
 		 314 aa  261  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  44.67 
 
 		 313 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2690  porphobilinogen deaminase  47.37 
 
 		 321 aa  260  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  47.24 
 
 		 315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  48.71 
 
 		 316 aa  259  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  44.63 
 
 		 315 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  44.7 
 
 		 309 aa  254  9e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  43.75 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2749  porphobilinogen deaminase  44.84 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3300  porphobilinogen deaminase  48.54 
 
 		 306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2898  porphobilinogen deaminase  48.54 
 
 		 306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101786  normal  0.0803505 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1437  porphobilinogen deaminase  44.77 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  43 
 
 		 318 aa  252  7e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04137  porphobilinogen deaminase  45.36 
 
 		 304 aa  251  8.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.870517  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0656  porphobilinogen deaminase  45.07 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3530  porphobilinogen deaminase  43.89 
 
 		 303 aa  249  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  43.32 
 
 		 310 aa  249  4e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  42.35 
 
 		 318 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3674  porphobilinogen deaminase  44.7 
 
 		 311 aa  248  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1200  porphobilinogen deaminase  43.51 
 
 		 321 aa  247  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.580193  normal  0.533215 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  45.03 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>