More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1347 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 309 aa  600  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  61.18 
 
 		 309 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  54.22 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  52.92 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  56.25 
 
 		 313 aa  302  5.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  47.59 
 
 		 313 aa  302  6.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  55.45 
 
 		 308 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  48.23 
 
 		 313 aa  298  6e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  52.81 
 
 		 310 aa  298  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  47.91 
 
 		 313 aa  296  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  51.62 
 
 		 320 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  51.64 
 
 		 320 aa  296  4e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  51.95 
 
 		 320 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  51.95 
 
 		 320 aa  295  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  55.19 
 
 		 320 aa  295  5e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  51.78 
 
 		 336 aa  295  7e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  46.18 
 
 		 313 aa  295  7e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  46.3 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  52.15 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  52.84 
 
 		 318 aa  292  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1680  porphobilinogen deaminase  50.16 
 
 		 317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 322 aa  289  5.0000000000000004e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07271  porphobilinogen deaminase  51.97 
 
 		 317 aa  288  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 309 aa  288  7e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  50.65 
 
 		 309 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  50.65 
 
 		 309 aa  286  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  50.65 
 
 		 309 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  50.65 
 
 		 309 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  50.99 
 
 		 309 aa  286  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  50.65 
 
 		 309 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  52.98 
 
 		 308 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  50.83 
 
 		 309 aa  285  5.999999999999999e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  50.66 
 
 		 309 aa  285  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 309 aa  285  8e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  50.66 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  50.49 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  56.72 
 
 		 312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0679  porphobilinogen deaminase  50.82 
 
 		 317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.451406  normal  0.332479 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  50.32 
 
 		 313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 309 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  45.02 
 
 		 312 aa  282  6.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  50 
 
 		 306 aa  281  7.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  46.13 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  48.37 
 
 		 311 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  50.82 
 
 		 310 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  51.8 
 
 		 314 aa  277  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  48.34 
 
 		 316 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04951  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 316 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.334606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  47.68 
 
 		 316 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  47.68 
 
 		 316 aa  275  5e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  47.56 
 
 		 311 aa  276  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  50.49 
 
 		 313 aa  275  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05521  porphobilinogen deaminase  48.69 
 
 		 315 aa  275  6e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.276961 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1828  porphobilinogen deaminase  48.37 
 
 		 315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  48.33 
 
 		 312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  49.5 
 
 		 314 aa  272  6e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  46.03 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  49.83 
 
 		 315 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  50.97 
 
 		 317 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 		 310 aa  268  8e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  53.38 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  48.68 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  49.34 
 
 		 320 aa  265  8e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  49.34 
 
 		 320 aa  265  8e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  49.34 
 
 		 320 aa  265  8e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  49.34 
 
 		 320 aa  265  8e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  49.34 
 
 		 313 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  49.34 
 
 		 313 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  45.54 
 
 		 310 aa  265  8.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  48.85 
 
 		 317 aa  264  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  49.34 
 
 		 318 aa  264  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  49.34 
 
 		 320 aa  264  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  49.02 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  51.84 
 
 		 312 aa  263  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  52.36 
 
 		 314 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 320 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 320 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  45.13 
 
 		 310 aa  262  6.999999999999999e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 318 aa  261  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  50.17 
 
 		 311 aa  261  8.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  46 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  48.52 
 
 		 311 aa  259  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  52.03 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  48.18 
 
 		 308 aa  259  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  52.03 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 313 aa  258  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 313 aa  258  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0035  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  45.89 
 
 		 321 aa  256  2e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  48.86 
 
 		 311 aa  256  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2690  porphobilinogen deaminase  48.86 
 
 		 321 aa  256  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  49.33 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  47.83 
 
 		 310 aa  256  4e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>