More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_4696 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  100 
 
 
309 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  99.68 
 
 
309 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  100 
 
 
309 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  98.38 
 
 
309 aa  617  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  98.38 
 
 
309 aa  617  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  98.38 
 
 
309 aa  616  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  96.44 
 
 
309 aa  607  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  97.41 
 
 
309 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  95.79 
 
 
309 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  94.5 
 
 
309 aa  591  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  90.29 
 
 
309 aa  568  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  69.44 
 
 
311 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  66.78 
 
 
310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1234  porphobilinogen deaminase  56.82 
 
 
308 aa  369  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0387484  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1762  porphobilinogen deaminase  57.19 
 
 
308 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1728  porphobilinogen deaminase  57.19 
 
 
308 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  50.67 
 
 
315 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  49.51 
 
 
309 aa  289  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  50.65 
 
 
309 aa  286  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  51.67 
 
 
310 aa  286  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 
318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  46.43 
 
 
309 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  51.32 
 
 
312 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  49.18 
 
 
316 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  49.34 
 
 
318 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  48.68 
 
 
309 aa  276  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  50 
 
 
309 aa  275  8e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0098  porphobilinogen deaminase  47.56 
 
 
345 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  48.01 
 
 
310 aa  272  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  48.54 
 
 
322 aa  271  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  48.17 
 
 
308 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  47.85 
 
 
318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  47.19 
 
 
318 aa  269  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 
313 aa  269  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  48.53 
 
 
320 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  48.53 
 
 
320 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  47.42 
 
 
308 aa  268  8.999999999999999e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  45.03 
 
 
324 aa  267  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  47.52 
 
 
318 aa  266  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  49.03 
 
 
315 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  48.51 
 
 
320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  48.67 
 
 
314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  47.87 
 
 
320 aa  265  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  48.21 
 
 
317 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  46.79 
 
 
311 aa  263  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  49.33 
 
 
317 aa  262  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  48.52 
 
 
320 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  48.52 
 
 
320 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  48.52 
 
 
313 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  45.15 
 
 
303 aa  262  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  48.52 
 
 
318 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  48.52 
 
 
313 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  47.04 
 
 
313 aa  262  6e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  49.34 
 
 
313 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0089  hydroxymethylbilane synthase  46.65 
 
 
345 aa  261  8e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  47.37 
 
 
316 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  49.34 
 
 
313 aa  260  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  47.04 
 
 
316 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  48.8 
 
 
285 aa  260  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  46.25 
 
 
309 aa  260  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  49.04 
 
 
313 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  46.6 
 
 
310 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  48.52 
 
 
320 aa  260  3e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  46.91 
 
 
310 aa  259  3e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 
313 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  47.04 
 
 
316 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  47.87 
 
 
313 aa  259  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1838  porphobilinogen deaminase  48.86 
 
 
305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  47.57 
 
 
312 aa  258  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  48.67 
 
 
309 aa  258  8e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  47.44 
 
 
315 aa  258  8e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  48.33 
 
 
312 aa  258  9e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  47.7 
 
 
322 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  48.68 
 
 
313 aa  257  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  47.25 
 
 
314 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  47.7 
 
 
318 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  44 
 
 
303 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  47.7 
 
 
320 aa  256  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  48.38 
 
 
313 aa  256  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  47.7 
 
 
320 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  47.54 
 
 
313 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  47.7 
 
 
320 aa  256  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  47.65 
 
 
311 aa  256  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  47.7 
 
 
318 aa  256  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  49 
 
 
312 aa  255  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  47.19 
 
 
313 aa  255  6e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.280442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  47.37 
 
 
313 aa  255  8e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  47.67 
 
 
317 aa  255  8e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  47.37 
 
 
313 aa  255  8e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  44.44 
 
 
313 aa  255  9e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  46.15 
 
 
321 aa  254  9e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  47.54 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  47.37 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  45.85 
 
 
311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  47.85 
 
 
313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  48.34 
 
 
313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  47.37 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  47.21 
 
 
313 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  46.15 
 
 
306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  45.1 
 
 
312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>