More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1680 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1680  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 317 aa  637    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0679  porphobilinogen deaminase  88.64 
 
 		 317 aa  566  1e-160  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.451406  normal  0.332479 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07271  porphobilinogen deaminase  82.65 
 
 		 317 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04951  porphobilinogen deaminase  76.9 
 
 		 316 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.334606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05521  porphobilinogen deaminase  77.39 
 
 		 315 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.276961 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1828  porphobilinogen deaminase  76.43 
 
 		 315 aa  484  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  72.93 
 
 		 316 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  72.93 
 
 		 316 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  72.29 
 
 		 316 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  68.15 
 
 		 316 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  69.84 
 
 		 320 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  71.79 
 
 		 320 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  69.26 
 
 		 322 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  69.18 
 
 		 320 aa  430  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  68.52 
 
 		 320 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  68.52 
 
 		 320 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  64.92 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  62.14 
 
 		 322 aa  399  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  56.54 
 
 		 309 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  53.55 
 
 		 318 aa  315  5e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  53.55 
 
 		 318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  52.9 
 
 		 318 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  52.26 
 
 		 318 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  51.61 
 
 		 318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  53.11 
 
 		 312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  53.55 
 
 		 317 aa  305  6e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  53.05 
 
 		 313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  52.26 
 
 		 313 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  53.42 
 
 		 313 aa  301  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  52.58 
 
 		 313 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  52.13 
 
 		 309 aa  299  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  54.19 
 
 		 309 aa  299  5e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  52.9 
 
 		 313 aa  298  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  52.9 
 
 		 310 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  52.61 
 
 		 312 aa  296  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  53.87 
 
 		 326 aa  296  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  51.94 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  52.58 
 
 		 313 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  50.97 
 
 		 310 aa  296  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  52.58 
 
 		 309 aa  296  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  53.44 
 
 		 315 aa  294  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  52.26 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  50.32 
 
 		 313 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  51.61 
 
 		 310 aa  292  5e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  50.32 
 
 		 313 aa  292  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  51.61 
 
 		 310 aa  292  6e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  51.61 
 
 		 310 aa  292  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  51.61 
 
 		 310 aa  292  6e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  48.52 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  50.49 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  51.94 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  51.29 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  52.58 
 
 		 313 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  51.61 
 
 		 310 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  51.61 
 
 		 310 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  51.61 
 
 		 310 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  52.74 
 
 		 315 aa  289  4e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  50.16 
 
 		 309 aa  289  5.0000000000000004e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  51.29 
 
 		 310 aa  288  7e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  51.48 
 
 		 311 aa  288  7e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  50.98 
 
 		 314 aa  288  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  49.04 
 
 		 309 aa  288  9e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  52.26 
 
 		 313 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  52.58 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  50.65 
 
 		 317 aa  285  7e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  50.49 
 
 		 312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  50 
 
 		 313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  50.16 
 
 		 312 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  50.32 
 
 		 322 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  51.48 
 
 		 313 aa  282  5.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  50.49 
 
 		 313 aa  282  7.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  49.68 
 
 		 313 aa  281  7.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  49.68 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  49.68 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  49.68 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  49.68 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  49.68 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  49.68 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  51.15 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  50.49 
 
 		 319 aa  280  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  51.15 
 
 		 313 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  49.35 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  48.85 
 
 		 351 aa  278  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  49.36 
 
 		 317 aa  277  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  50.66 
 
 		 326 aa  276  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  49.52 
 
 		 311 aa  276  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  48.37 
 
 		 315 aa  275  6e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 313 aa  275  8e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  49.18 
 
 		 313 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0700  porphobilinogen deaminase  49.52 
 
 		 334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 		 308 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  48.23 
 
 		 308 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0035  porphobilinogen deaminase  51.16 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  49.03 
 
 		 313 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  49.03 
 
 		 320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  49.03 
 
 		 313 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2690  porphobilinogen deaminase  51.51 
 
 		 321 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  49.03 
 
 		 318 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>