More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_1249 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  100 
 
 
313 aa  615  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  56.38 
 
 
315 aa  322  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  53.57 
 
 
309 aa  321  9.000000000000001e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  53.29 
 
 
309 aa  318  5e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  52.77 
 
 
320 aa  310  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  54.82 
 
 
318 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  53.11 
 
 
306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  53.31 
 
 
310 aa  306  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  53.31 
 
 
318 aa  305  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  54.58 
 
 
308 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  56.25 
 
 
309 aa  302  5.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  50.81 
 
 
316 aa  301  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1680  porphobilinogen deaminase  53.42 
 
 
317 aa  301  1e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  51.79 
 
 
320 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  52.16 
 
 
318 aa  298  7e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  48.54 
 
 
316 aa  298  7e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  50.98 
 
 
316 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  50.65 
 
 
316 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07271  porphobilinogen deaminase  52.75 
 
 
317 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05521  porphobilinogen deaminase  50.16 
 
 
315 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.276961 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  50.66 
 
 
318 aa  295  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  50.66 
 
 
318 aa  294  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  53.27 
 
 
320 aa  293  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  51.14 
 
 
320 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  53.64 
 
 
308 aa  293  4e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  51.14 
 
 
320 aa  292  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1828  porphobilinogen deaminase  49.51 
 
 
315 aa  292  5e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  49.19 
 
 
336 aa  292  6e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  51.47 
 
 
322 aa  291  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0679  porphobilinogen deaminase  52.12 
 
 
317 aa  291  8e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.451406  normal  0.332479 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  48.36 
 
 
322 aa  290  3e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  51.8 
 
 
309 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04951  porphobilinogen deaminase  48.85 
 
 
316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.334606  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  53.16 
 
 
312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  51.16 
 
 
351 aa  280  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  51.5 
 
 
309 aa  279  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  49.35 
 
 
310 aa  278  8e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  48.08 
 
 
311 aa  278  8e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  49.84 
 
 
314 aa  276  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  49.83 
 
 
310 aa  276  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  50.82 
 
 
313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  46.05 
 
 
313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  50.49 
 
 
310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  51.29 
 
 
313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  50.66 
 
 
317 aa  273  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  48.7 
 
 
311 aa  273  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 
312 aa  273  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  50 
 
 
313 aa  272  6e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  45.93 
 
 
313 aa  271  8.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  47.04 
 
 
313 aa  271  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  50.65 
 
 
313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  50 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  50.64 
 
 
317 aa  269  5e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  52.29 
 
 
312 aa  269  5e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  45.39 
 
 
312 aa  269  5e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  50.16 
 
 
326 aa  269  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  49.19 
 
 
311 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 
310 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  50.16 
 
 
313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  46.25 
 
 
313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  50.82 
 
 
314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  46.58 
 
 
313 aa  266  4e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 
322 aa  266  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  44.95 
 
 
313 aa  265  5.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 
306 aa  265  8e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 
309 aa  265  8e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 
309 aa  264  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  47.96 
 
 
324 aa  264  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  47.87 
 
 
310 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.364632 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  49.83 
 
 
320 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  47.23 
 
 
317 aa  263  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  49.83 
 
 
318 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  49.83 
 
 
318 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  49.83 
 
 
320 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  50 
 
 
308 aa  264  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  49.83 
 
 
320 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  49.83 
 
 
320 aa  263  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  49.83 
 
 
313 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  49.83 
 
 
313 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  47.54 
 
 
310 aa  263  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  47.54 
 
 
310 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  48.2 
 
 
310 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  48.7 
 
 
311 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  47.54 
 
 
310 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  47.54 
 
 
310 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  47.54 
 
 
310 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  47.54 
 
 
310 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  47.54 
 
 
310 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  49.83 
 
 
317 aa  262  6e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 
320 aa  262  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 
312 aa  261  8.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  48.2 
 
 
311 aa  260  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  49.35 
 
 
312 aa  260  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 
313 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 
312 aa  260  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 
313 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04137  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 
304 aa  259  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.870517  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  47.02 
 
 
310 aa  260  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  47.83 
 
 
309 aa  259  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  49 
 
 
326 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>