More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03629 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  626  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  100 
 
 
313 aa  626  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  99.68 
 
 
320 aa  625  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  99.68 
 
 
320 aa  625  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  99.68 
 
 
320 aa  625  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  99.36 
 
 
318 aa  624  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  99.04 
 
 
320 aa  623  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  99.36 
 
 
318 aa  623  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  99.04 
 
 
320 aa  623  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  88.82 
 
 
313 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  88.82 
 
 
320 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  88.82 
 
 
318 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  88.82 
 
 
320 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  88.82 
 
 
313 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  86.58 
 
 
313 aa  548  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  82.64 
 
 
313 aa  510  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  80.19 
 
 
313 aa  505  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  80.51 
 
 
313 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  80.26 
 
 
322 aa  500  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  80.51 
 
 
313 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  80.51 
 
 
313 aa  498  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  78.59 
 
 
313 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  79.22 
 
 
313 aa  480  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  75.9 
 
 
317 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  75.91 
 
 
312 aa  461  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  75.58 
 
 
312 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  75.25 
 
 
311 aa  457  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  72.31 
 
 
317 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  71.01 
 
 
309 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  70.03 
 
 
309 aa  435  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  69.38 
 
 
310 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  71.01 
 
 
315 aa  432  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  69.38 
 
 
309 aa  428  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  67.86 
 
 
310 aa  429  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  69.71 
 
 
310 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  69.71 
 
 
310 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  69.38 
 
 
310 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  69.38 
 
 
310 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  69.38 
 
 
310 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  69.06 
 
 
310 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  69.87 
 
 
312 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  69.06 
 
 
310 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  69.38 
 
 
310 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  69.06 
 
 
310 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  69.06 
 
 
326 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  68.09 
 
 
312 aa  418  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  68.18 
 
 
314 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0061  porphobilinogen deaminase  63.02 
 
 
311 aa  409  1e-113  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  65.26 
 
 
309 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  67.53 
 
 
313 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  67.21 
 
 
313 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  66.23 
 
 
313 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  67.55 
 
 
313 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  67.22 
 
 
313 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  65.89 
 
 
313 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  67.33 
 
 
308 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  67.1 
 
 
311 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  66.56 
 
 
313 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  66.56 
 
 
313 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  63.73 
 
 
310 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  64.12 
 
 
326 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  62.58 
 
 
321 aa  386  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  65.48 
 
 
317 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  62.62 
 
 
313 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  66.23 
 
 
313 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  60.91 
 
 
309 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  62.5 
 
 
319 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  63.61 
 
 
351 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  57.45 
 
 
339 aa  364  1e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  62.87 
 
 
316 aa  364  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  61.11 
 
 
310 aa  363  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  60.39 
 
 
308 aa  361  9e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  63.19 
 
 
315 aa  351  8e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0098  porphobilinogen deaminase  53.59 
 
 
345 aa  347  1e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0089  hydroxymethylbilane synthase  53.59 
 
 
345 aa  345  5e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  57.33 
 
 
314 aa  336  2.9999999999999997e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  55.19 
 
 
318 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1437  porphobilinogen deaminase  57.53 
 
 
310 aa  322  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3674  porphobilinogen deaminase  55.15 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  54.22 
 
 
318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  51.79 
 
 
310 aa  320  3e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  52.92 
 
 
318 aa  317  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  57.14 
 
 
317 aa  316  4e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2749  porphobilinogen deaminase  53.99 
 
 
334 aa  315  6e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319663  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  55 
 
 
306 aa  315  7e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  53.14 
 
 
318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2690  porphobilinogen deaminase  57.48 
 
 
321 aa  311  6.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  55.52 
 
 
313 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  54.79 
 
 
310 aa  308  9e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2571  porphobilinogen deaminase  55.95 
 
 
338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2357  porphobilinogen deaminase  57.23 
 
 
334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206721  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  52.15 
 
 
318 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  56.07 
 
 
310 aa  306  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0700  porphobilinogen deaminase  54.14 
 
 
334 aa  305  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  52.65 
 
 
308 aa  305  7e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2166  porphobilinogen deaminase  55.31 
 
 
338 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.600756 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  54.4 
 
 
316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  55.19 
 
 
314 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1322  porphobilinogen deaminase  51.83 
 
 
314 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0767  porphobilinogen deaminase  52.98 
 
 
311 aa  301  7.000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>