More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3180 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 309 aa  629  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  92.23 
 
 		 309 aa  577  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  91.91 
 
 		 309 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  91.26 
 
 		 309 aa  573  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  91.26 
 
 		 309 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  90.29 
 
 		 309 aa  568  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  90.61 
 
 		 309 aa  568  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  90.61 
 
 		 309 aa  568  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  90.61 
 
 		 309 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  90.29 
 
 		 309 aa  568  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  89.97 
 
 		 309 aa  566  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  69.06 
 
 		 311 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  65.47 
 
 		 310 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1234  porphobilinogen deaminase  54.87 
 
 		 308 aa  360  1e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0387484  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1762  porphobilinogen deaminase  54.87 
 
 		 308 aa  358  7e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1728  porphobilinogen deaminase  54.87 
 
 		 308 aa  358  7e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  50.99 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 309 aa  292  6e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  53 
 
 		 310 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 309 aa  288  7e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  49.34 
 
 		 318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  46.13 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  49.34 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0098  porphobilinogen deaminase  48.48 
 
 		 345 aa  277  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  48.34 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  49.18 
 
 		 316 aa  276  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  48.03 
 
 		 318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 312 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  48.17 
 
 		 308 aa  271  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  44.41 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  49.03 
 
 		 317 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  47.74 
 
 		 308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  51.32 
 
 		 313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  47.7 
 
 		 318 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  45.67 
 
 		 303 aa  267  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  48.36 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  47.88 
 
 		 311 aa  266  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  47.91 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  47.7 
 
 		 318 aa  265  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 318 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 313 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 313 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  49.83 
 
 		 320 aa  265  8e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  47.54 
 
 		 313 aa  265  8.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 309 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0089  hydroxymethylbilane synthase  47.56 
 
 		 345 aa  264  1e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  48.8 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 318 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  46.84 
 
 		 319 aa  263  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  46.6 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 318 aa  263  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  44.85 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  48.66 
 
 		 311 aa  262  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  47.08 
 
 		 314 aa  262  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  48.38 
 
 		 315 aa  262  6e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  45.02 
 
 		 313 aa  261  6.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  47.88 
 
 		 320 aa  261  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  47.88 
 
 		 320 aa  261  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  49.16 
 
 		 313 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  49.16 
 
 		 313 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 		 317 aa  261  8.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  46.75 
 
 		 310 aa  261  8.999999999999999e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  48.01 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  49.16 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  48.49 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  47.08 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  47.78 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1838  porphobilinogen deaminase  49.83 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  49 
 
 		 314 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  49.51 
 
 		 313 aa  259  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  46.28 
 
 		 310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  49.51 
 
 		 313 aa  258  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  47.57 
 
 		 313 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  44.37 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  47.57 
 
 		 313 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  49.51 
 
 		 313 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  46.56 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 313 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  46.15 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  48.33 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  48 
 
 		 313 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  48.33 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  48.17 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  47.67 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  48.51 
 
 		 313 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  46.41 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  48.37 
 
 		 313 aa  256  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  46.15 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  49.45 
 
 		 311 aa  256  5e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  47.52 
 
 		 320 aa  255  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  47.06 
 
 		 320 aa  255  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  47.35 
 
 		 317 aa  255  6e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  46.56 
 
 		 316 aa  255  7e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>