More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1289 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 324 aa  636    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  54.34 
 
 		 303 aa  292  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  52.41 
 
 		 303 aa  281  9e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  45.31 
 
 		 313 aa  276  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 315 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  48.55 
 
 		 309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  46.54 
 
 		 306 aa  271  8.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  49.04 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  44.41 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  45.34 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  44.69 
 
 		 313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  44.38 
 
 		 312 aa  270  4e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  42.45 
 
 		 316 aa  269  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  45.34 
 
 		 309 aa  269  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  45.34 
 
 		 309 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  45.03 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  45.03 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  45.34 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  45.03 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  45.34 
 
 		 309 aa  266  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  44.69 
 
 		 313 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  47.32 
 
 		 310 aa  265  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  47.96 
 
 		 313 aa  264  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  45.03 
 
 		 309 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  42.45 
 
 		 316 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  45.03 
 
 		 309 aa  263  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  43.75 
 
 		 313 aa  263  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  46.3 
 
 		 322 aa  262  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  48.24 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  43.49 
 
 		 316 aa  262  6e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  48.7 
 
 		 314 aa  261  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  46.08 
 
 		 310 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  42.86 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  44.69 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  45.02 
 
 		 320 aa  261  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  44.06 
 
 		 313 aa  260  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  43.35 
 
 		 309 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  48.88 
 
 		 313 aa  258  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  48.7 
 
 		 314 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  48.7 
 
 		 314 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  45.37 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  43.81 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  44.83 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  43.75 
 
 		 313 aa  257  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  45.48 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  42.59 
 
 		 311 aa  255  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  48.7 
 
 		 313 aa  255  9e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  48.39 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  44.44 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  45.43 
 
 		 320 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  46.67 
 
 		 309 aa  251  8.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  46.06 
 
 		 313 aa  251  9.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  44.06 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  44.03 
 
 		 310 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  47.12 
 
 		 320 aa  250  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  42.81 
 
 		 309 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07271  porphobilinogen deaminase  45.11 
 
 		 317 aa  248  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  49.06 
 
 		 312 aa  248  8e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  44.95 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05521  porphobilinogen deaminase  43.17 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.276961 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  42.94 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1828  porphobilinogen deaminase  42.9 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  42.32 
 
 		 322 aa  246  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  46.65 
 
 		 312 aa  246  4e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  47.59 
 
 		 313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04951  porphobilinogen deaminase  42.86 
 
 		 316 aa  245  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.334606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  46.96 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  43.85 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0679  porphobilinogen deaminase  43.85 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.451406  normal  0.332479 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  40.74 
 
 		 313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  43.21 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  44.48 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  45.54 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1680  porphobilinogen deaminase  43.35 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  48.01 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  44.48 
 
 		 320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  43.08 
 
 		 310 aa  242  6e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  42.9 
 
 		 318 aa  242  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  45.98 
 
 		 313 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  46.33 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  44.37 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  47.42 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  45.66 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  44.48 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  46.33 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  46.03 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  46.03 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  46.03 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  44.37 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  45.74 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  45.11 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  46.06 
 
 		 320 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  46.33 
 
 		 320 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  46.33 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  46.06 
 
 		 320 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  45.74 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  43.93 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  42.77 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  45.74 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  46.03 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>