More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1251 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 309 aa  617  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  61.18 
 
 		 309 aa  361  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  55.78 
 
 		 309 aa  353  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  53.27 
 
 		 320 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  53.07 
 
 		 322 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  53.57 
 
 		 313 aa  321  9.000000000000001e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  52.94 
 
 		 320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  52.43 
 
 		 336 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  52.79 
 
 		 318 aa  317  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  52.44 
 
 		 320 aa  316  3e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  52.13 
 
 		 310 aa  315  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  52.61 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  52.82 
 
 		 318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  51.31 
 
 		 318 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  51.96 
 
 		 318 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  52.46 
 
 		 308 aa  308  9e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  51.16 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 315 aa  301  6.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  51.96 
 
 		 306 aa  301  8.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0679  porphobilinogen deaminase  50.16 
 
 		 317 aa  299  4e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.451406  normal  0.332479 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07271  porphobilinogen deaminase  50.32 
 
 		 317 aa  298  6e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  52.15 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  53.14 
 
 		 308 aa  295  8e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05521  porphobilinogen deaminase  49.51 
 
 		 315 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.276961 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1828  porphobilinogen deaminase  49.19 
 
 		 315 aa  291  7e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  48.54 
 
 		 322 aa  291  8e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  47.85 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  51.17 
 
 		 313 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1680  porphobilinogen deaminase  49.04 
 
 		 317 aa  288  8e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  49.02 
 
 		 314 aa  287  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  51.16 
 
 		 312 aa  286  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  48.37 
 
 		 313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  48.85 
 
 		 313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  46.2 
 
 		 312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  49.83 
 
 		 310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  49.83 
 
 		 310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  49.83 
 
 		 310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  48.04 
 
 		 313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  46.75 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  47.71 
 
 		 313 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  48.83 
 
 		 318 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  46.43 
 
 		 309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 310 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  46.75 
 
 		 309 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  46.77 
 
 		 309 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  48.83 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  48.83 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  48.83 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  46.43 
 
 		 309 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  46.43 
 
 		 309 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  48.83 
 
 		 320 aa  281  7.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  48.83 
 
 		 318 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  48.83 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  48.83 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  48.83 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  46.1 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  46.73 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  46.13 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  47.08 
 
 		 310 aa  279  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  46.45 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  45.81 
 
 		 309 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  45.95 
 
 		 313 aa  279  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  46.28 
 
 		 312 aa  279  5e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  49.66 
 
 		 311 aa  278  7e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  48.21 
 
 		 310 aa  278  7e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 		 310 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 		 310 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 		 310 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  46.36 
 
 		 316 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  48.2 
 
 		 317 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  47.21 
 
 		 326 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  46.89 
 
 		 316 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  47.39 
 
 		 313 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  47.51 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  47.02 
 
 		 316 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  45.81 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  48.84 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04951  porphobilinogen deaminase  47.56 
 
 		 316 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.334606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  45.95 
 
 		 311 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  47.83 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  47.83 
 
 		 320 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  47.83 
 
 		 320 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  47.83 
 
 		 313 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  47.83 
 
 		 313 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  45.63 
 
 		 313 aa  275  6e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  45.95 
 
 		 313 aa  275  6e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  45.57 
 
 		 316 aa  275  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  47.19 
 
 		 310 aa  275  7e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  47.51 
 
 		 310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  49.66 
 
 		 312 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  47.18 
 
 		 317 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  46.28 
 
 		 313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  47.87 
 
 		 313 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  46.73 
 
 		 311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  47.71 
 
 		 313 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  46.49 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  47.16 
 
 		 309 aa  273  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  46.05 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>