More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0685 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  100 
 
 		 306 aa  610  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  53.11 
 
 		 313 aa  307  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  51.96 
 
 		 318 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  51.32 
 
 		 318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  51.63 
 
 		 318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  52.41 
 
 		 318 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  51.96 
 
 		 309 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  49.51 
 
 		 313 aa  300  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  50.16 
 
 		 318 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  51.8 
 
 		 308 aa  296  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  47.25 
 
 		 313 aa  295  6e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  52.35 
 
 		 314 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  50.99 
 
 		 310 aa  292  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  51.51 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  51.99 
 
 		 313 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  46.6 
 
 		 313 aa  285  7e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  46.28 
 
 		 313 aa  285  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  47.21 
 
 		 309 aa  285  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  46.6 
 
 		 312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 309 aa  281  7.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  48.04 
 
 		 313 aa  281  7.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  46.28 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  51.5 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  51.5 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  51.82 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  50.83 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  48.23 
 
 		 322 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  46.28 
 
 		 313 aa  279  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  51.16 
 
 		 314 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  49.18 
 
 		 310 aa  279  4e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 312 aa  278  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 312 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  49.51 
 
 		 317 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 351 aa  276  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 		 303 aa  275  8e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  48.71 
 
 		 316 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  50.34 
 
 		 313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  48.84 
 
 		 320 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  48.84 
 
 		 318 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  48.84 
 
 		 320 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 		 313 aa  272  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  48.53 
 
 		 316 aa  272  7e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  48.84 
 
 		 313 aa  271  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  46.54 
 
 		 324 aa  271  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  48.84 
 
 		 313 aa  271  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  46.33 
 
 		 312 aa  271  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  49.33 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  46.53 
 
 		 336 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  47.85 
 
 		 309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  44.22 
 
 		 308 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  46.62 
 
 		 321 aa  269  2.9999999999999997e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  47.19 
 
 		 316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  47.19 
 
 		 313 aa  269  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  47.02 
 
 		 320 aa  268  5.9999999999999995e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  48.18 
 
 		 316 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  48.37 
 
 		 315 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  48.17 
 
 		 320 aa  266  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  48.17 
 
 		 320 aa  266  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  46.98 
 
 		 310 aa  266  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  48.17 
 
 		 320 aa  266  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  46.23 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  48.17 
 
 		 318 aa  266  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  48.17 
 
 		 320 aa  266  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  48.17 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  46.23 
 
 		 320 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  48.17 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  47.19 
 
 		 316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  46.53 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  48.99 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  47.84 
 
 		 313 aa  265  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  48.84 
 
 		 308 aa  265  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  47.84 
 
 		 313 aa  265  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  48.66 
 
 		 313 aa  264  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  47.97 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  45.97 
 
 		 317 aa  263  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  48.66 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  46.69 
 
 		 316 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  46.98 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  48.66 
 
 		 313 aa  263  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  46.64 
 
 		 326 aa  263  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  46.51 
 
 		 310 aa  263  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  48.66 
 
 		 322 aa  262  4.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  47.51 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  47.18 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  44.33 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  46.82 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  45.97 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  47.33 
 
 		 313 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  45.72 
 
 		 311 aa  259  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  47.52 
 
 		 313 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  46.31 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  45.39 
 
 		 320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  46.31 
 
 		 312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1322  porphobilinogen deaminase  44.48 
 
 		 314 aa  258  8e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  45.39 
 
 		 320 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  47.93 
 
 		 285 aa  258  8e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  47.67 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>