More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0089 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0089  hydroxymethylbilane synthase  100 
 
 		 345 aa  696    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0098  porphobilinogen deaminase  94.2 
 
 		 345 aa  626  1e-178  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  72.22 
 
 		 339 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  57.44 
 
 		 321 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  57.23 
 
 		 312 aa  364  1e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  57.27 
 
 		 313 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  56.76 
 
 		 317 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  57.19 
 
 		 311 aa  362  8e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  56.68 
 
 		 313 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  58.43 
 
 		 313 aa  360  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  55.22 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  55.22 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  56.33 
 
 		 309 aa  360  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  55.22 
 
 		 318 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  55.22 
 
 		 313 aa  359  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  55.22 
 
 		 313 aa  359  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  56.76 
 
 		 312 aa  359  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  56.46 
 
 		 312 aa  359  4e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  55.72 
 
 		 313 aa  359  5e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  55.85 
 
 		 317 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  54.82 
 
 		 309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  56.02 
 
 		 313 aa  355  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  56.46 
 
 		 309 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  55.59 
 
 		 313 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  56.8 
 
 		 310 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  56.5 
 
 		 326 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  55.42 
 
 		 313 aa  354  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  55.29 
 
 		 310 aa  353  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  55.49 
 
 		 312 aa  350  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  55.89 
 
 		 310 aa  349  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  53.89 
 
 		 318 aa  349  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  54.9 
 
 		 313 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  53.89 
 
 		 320 aa  349  5e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  54.68 
 
 		 313 aa  349  5e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  53.89 
 
 		 320 aa  349  5e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  55.49 
 
 		 313 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  53.89 
 
 		 320 aa  349  5e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  53.89 
 
 		 318 aa  348  7e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  55.59 
 
 		 310 aa  348  7e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  53.89 
 
 		 320 aa  348  8e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  55.59 
 
 		 310 aa  348  8e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  55.59 
 
 		 310 aa  348  8e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  55.59 
 
 		 310 aa  348  8e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  53.89 
 
 		 320 aa  348  9e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  53.87 
 
 		 313 aa  348  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  53.59 
 
 		 313 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  53.59 
 
 		 313 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  55.89 
 
 		 310 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  55.89 
 
 		 310 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  55.89 
 
 		 310 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  56.33 
 
 		 309 aa  346  4e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  54.65 
 
 		 322 aa  346  4e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  55.59 
 
 		 309 aa  345  5e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  55.59 
 
 		 310 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  54.98 
 
 		 315 aa  345  7e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  54.82 
 
 		 313 aa  344  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  55.29 
 
 		 313 aa  343  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  55.29 
 
 		 313 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  53.92 
 
 		 326 aa  342  5.999999999999999e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  54.98 
 
 		 313 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  54.38 
 
 		 313 aa  340  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  54.08 
 
 		 311 aa  338  7e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  53.87 
 
 		 314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  54.35 
 
 		 316 aa  335  5e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  54.9 
 
 		 313 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  54.35 
 
 		 317 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  54.9 
 
 		 313 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  54.55 
 
 		 315 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  53.29 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0061  porphobilinogen deaminase  50.6 
 
 		 311 aa  321  9.999999999999999e-87  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  51.03 
 
 		 319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  51.83 
 
 		 308 aa  318  7.999999999999999e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  51.04 
 
 		 310 aa  317  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  53.29 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  50.6 
 
 		 351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  50.89 
 
 		 316 aa  299  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  48.66 
 
 		 317 aa  292  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  50.75 
 
 		 310 aa  292  6e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  48.95 
 
 		 306 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  47.94 
 
 		 314 aa  289  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3674  porphobilinogen deaminase  48.24 
 
 		 311 aa  288  8e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1437  porphobilinogen deaminase  48.81 
 
 		 310 aa  286  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  48.49 
 
 		 315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0035  porphobilinogen deaminase  48.81 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2791  porphobilinogen deaminase  46.06 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2660  porphobilinogen deaminase  45.76 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0525  porphobilinogen deaminase  49.7 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3530  porphobilinogen deaminase  47.43 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2690  porphobilinogen deaminase  48.78 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0764  porphobilinogen deaminase  47.95 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000120999 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0730  porphobilinogen deaminase  57.83 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1077  porphobilinogen deaminase  57.83 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.941716  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1229  porphobilinogen deaminase  57.83 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0872  porphobilinogen deaminase  49.55 
 
 		 329 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2166  porphobilinogen deaminase  49.4 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.600756 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3000  porphobilinogen deaminase  57.83 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1813  porphobilinogen deaminase  50.84 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.57316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2284  porphobilinogen deaminase  57.83 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2429  porphobilinogen deaminase  50.84 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.237637 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1597  porphobilinogen deaminase  57.83 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>