More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1363 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  100 
 
 
314 aa  611  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  100 
 
 
314 aa  611  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  97.45 
 
 
314 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  84.66 
 
 
313 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  55.48 
 
 
310 aa  308  5e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  56.03 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  53 
 
 
314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  54.58 
 
 
322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  53.16 
 
 
309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  54.87 
 
 
320 aa  302  5.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  54.18 
 
 
310 aa  301  6.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  54.55 
 
 
318 aa  301  9e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.473943 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  54.55 
 
 
320 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  54.55 
 
 
320 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  54.55 
 
 
320 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  54.55 
 
 
313 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  54.55 
 
 
318 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  54.55 
 
 
313 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  54.55 
 
 
320 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  55.37 
 
 
315 aa  298  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  55.18 
 
 
313 aa  298  9e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  53.57 
 
 
313 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  55.67 
 
 
313 aa  297  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  55.18 
 
 
313 aa  296  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  52.92 
 
 
320 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  52.92 
 
 
320 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  52.92 
 
 
318 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  52.92 
 
 
313 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  52.92 
 
 
313 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  53.09 
 
 
313 aa  294  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  47.9 
 
 
310 aa  294  1e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  54.85 
 
 
313 aa  294  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  52.16 
 
 
318 aa  293  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  51.5 
 
 
310 aa  293  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  55.81 
 
 
315 aa  292  5e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  53.18 
 
 
309 aa  292  6e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  53.33 
 
 
313 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  51.5 
 
 
310 aa  291  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  53.33 
 
 
313 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  52.29 
 
 
315 aa  289  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  52.15 
 
 
317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  50.83 
 
 
318 aa  288  8e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  51.83 
 
 
316 aa  287  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  52.17 
 
 
309 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  51.51 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  51.84 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  51.51 
 
 
351 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  53.18 
 
 
326 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  51.5 
 
 
310 aa  282  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  52.84 
 
 
308 aa  281  7.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  51.8 
 
 
310 aa  281  9e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  51.8 
 
 
310 aa  281  9e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  51.8 
 
 
310 aa  281  9e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  51.8 
 
 
310 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  50.34 
 
 
311 aa  280  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  51.5 
 
 
306 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  51.48 
 
 
310 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  51.68 
 
 
317 aa  279  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 
318 aa  279  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  51.48 
 
 
310 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0525  porphobilinogen deaminase  51.16 
 
 
311 aa  279  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  51.48 
 
 
310 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  51.48 
 
 
310 aa  278  8e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  51.68 
 
 
312 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  50.99 
 
 
311 aa  277  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  51.15 
 
 
310 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  50.84 
 
 
309 aa  277  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 
318 aa  276  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  51.34 
 
 
312 aa  276  5e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 
318 aa  275  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 
319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2791  porphobilinogen deaminase  47 
 
 
309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  51.5 
 
 
316 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  51.33 
 
 
312 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  52 
 
 
311 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  46.2 
 
 
313 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 
312 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2660  porphobilinogen deaminase  46.67 
 
 
309 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  48.86 
 
 
313 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 
313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  49.16 
 
 
326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0767  porphobilinogen deaminase  45.9 
 
 
311 aa  269  4e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  46.45 
 
 
321 aa  269  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  43.75 
 
 
308 aa  268  5.9999999999999995e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  47.87 
 
 
309 aa  268  8e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  49.33 
 
 
308 aa  268  8.999999999999999e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0649  porphobilinogen deaminase  43.71 
 
 
307 aa  267  1e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.485602  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0061  porphobilinogen deaminase  47.83 
 
 
311 aa  267  1e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  49.18 
 
 
313 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0570  porphobilinogen deaminase  43.71 
 
 
307 aa  267  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  49.18 
 
 
313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  51.69 
 
 
303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0767  porphobilinogen deaminase  44.55 
 
 
308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  50.69 
 
 
315 aa  266  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  47.59 
 
 
311 aa  265  5e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  49.18 
 
 
313 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1385  porphobilinogen deaminase  43.38 
 
 
307 aa  265  7e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  49.16 
 
 
300 aa  265  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  49.51 
 
 
313 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  50.34 
 
 
303 aa  264  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>