More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1237 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 285 aa  573  1.0000000000000001e-162  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  55.74 
 
 		 310 aa  315  7e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  52.23 
 
 		 308 aa  288  9e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  51.03 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  50.17 
 
 		 311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  48.28 
 
 		 314 aa  281  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  52.55 
 
 		 310 aa  281  9e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 326 aa  281  9e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  50.34 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  50.17 
 
 		 310 aa  279  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  50.69 
 
 		 317 aa  278  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 315 aa  277  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  52.27 
 
 		 314 aa  277  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  48.28 
 
 		 351 aa  276  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  51.03 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  49.66 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  49.48 
 
 		 310 aa  276  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  49.48 
 
 		 310 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  49.48 
 
 		 310 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  49.48 
 
 		 310 aa  276  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  52.08 
 
 		 313 aa  275  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  49.15 
 
 		 313 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  51.03 
 
 		 312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  52.27 
 
 		 313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  50.34 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  49.48 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  51.46 
 
 		 321 aa  273  3e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  49.83 
 
 		 318 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  49.66 
 
 		 315 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  46.21 
 
 		 309 aa  271  6e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  51.52 
 
 		 312 aa  271  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  49.14 
 
 		 310 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  49.14 
 
 		 310 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  49.14 
 
 		 310 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  50.69 
 
 		 320 aa  270  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  50.69 
 
 		 320 aa  270  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  52.27 
 
 		 313 aa  270  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  50.69 
 
 		 320 aa  270  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  50.69 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  50.69 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  48.46 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  49.31 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  50.34 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  50.69 
 
 		 313 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  52.83 
 
 		 320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  50.34 
 
 		 313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  50.69 
 
 		 313 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  50.34 
 
 		 320 aa  269  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  49.31 
 
 		 309 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  46.21 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  47.26 
 
 		 315 aa  266  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  49.83 
 
 		 326 aa  266  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  48.29 
 
 		 317 aa  265  5.999999999999999e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  47.97 
 
 		 317 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  49.15 
 
 		 313 aa  265  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  50.76 
 
 		 313 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  51.89 
 
 		 320 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  51.89 
 
 		 320 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  48.12 
 
 		 318 aa  265  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  50.76 
 
 		 313 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  51.89 
 
 		 318 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  51.89 
 
 		 313 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  51.89 
 
 		 313 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  51.14 
 
 		 312 aa  264  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  48.8 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  50.76 
 
 		 313 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  48.28 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  51.32 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  48.62 
 
 		 317 aa  263  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  49.31 
 
 		 318 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  51.32 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  47.1 
 
 		 310 aa  264  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  50.57 
 
 		 313 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  51.32 
 
 		 313 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  49.48 
 
 		 312 aa  262  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0525  porphobilinogen deaminase  47.93 
 
 		 311 aa  262  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  47.93 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1762  porphobilinogen deaminase  46.9 
 
 		 308 aa  262  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3300  porphobilinogen deaminase  46.62 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1728  porphobilinogen deaminase  46.9 
 
 		 308 aa  262  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2898  porphobilinogen deaminase  46.62 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101786  normal  0.0803505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  47.44 
 
 		 313 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  49.06 
 
 		 316 aa  261  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  49.14 
 
 		 309 aa  261  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1234  porphobilinogen deaminase  47.93 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0387484  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  48.8 
 
 		 309 aa  260  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  50.57 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  48.8 
 
 		 309 aa  260  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  48.8 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  47.57 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  48.8 
 
 		 309 aa  259  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  48.45 
 
 		 309 aa  259  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3090  porphobilinogen deaminase  51.79 
 
 		 331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  48.45 
 
 		 309 aa  258  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  47.93 
 
 		 306 aa  258  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  47.92 
 
 		 308 aa  258  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  47.74 
 
 		 303 aa  257  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  49.45 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>