More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12370 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 313 aa  628  1e-179  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  48.7 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2070  porphobilinogen deaminase  51.09 
 
 		 327 aa  285  7e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0208859  hitchhiker  0.0000965484 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  46.18 
 
 		 313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  50.32 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  48.04 
 
 		 306 aa  281  7.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  46.03 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  45.54 
 
 		 313 aa  275  9e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  44.76 
 
 		 313 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  46.45 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  43.95 
 
 		 312 aa  269  4e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  45.08 
 
 		 313 aa  268  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  45.83 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  50.16 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  42.36 
 
 		 313 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  46.33 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  43.69 
 
 		 318 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  47.57 
 
 		 308 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  42.72 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  44.41 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  42.07 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  45.83 
 
 		 336 aa  255  6e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  44.37 
 
 		 316 aa  255  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  43.87 
 
 		 310 aa  254  9e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  41.42 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  44.55 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0525  porphobilinogen deaminase  45.6 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  42.39 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2749  porphobilinogen deaminase  45.81 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  44.05 
 
 		 316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  43.73 
 
 		 312 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  44.23 
 
 		 313 aa  251  7e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  43.41 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  44.23 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  45.19 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  45.63 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  44.84 
 
 		 320 aa  251  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  44.87 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  44.69 
 
 		 322 aa  249  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  44.87 
 
 		 313 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  43.41 
 
 		 316 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  44.87 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  45.66 
 
 		 320 aa  248  7e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  41.5 
 
 		 311 aa  248  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  43.79 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  43.51 
 
 		 320 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  42.9 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  45.02 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  45.02 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  45.05 
 
 		 312 aa  246  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07271  porphobilinogen deaminase  45.83 
 
 		 317 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  44.73 
 
 		 312 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  43.97 
 
 		 311 aa  246  4.9999999999999997e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  41.67 
 
 		 309 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  43.3 
 
 		 321 aa  245  6e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  42.72 
 
 		 313 aa  245  9e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  47.28 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  44.19 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0700  porphobilinogen deaminase  44.69 
 
 		 334 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  44.23 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  45.78 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  43.27 
 
 		 326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  44.52 
 
 		 317 aa  242  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  44.01 
 
 		 310 aa  242  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  42.63 
 
 		 308 aa  242  7e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  42.9 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  44.34 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  45.1 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  43.69 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  43.27 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  44.52 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  41.67 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  43.27 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  44.34 
 
 		 313 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  43.69 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  44.87 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  44.34 
 
 		 320 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  44.34 
 
 		 320 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  44.3 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  44.34 
 
 		 313 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  43.69 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  43.37 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  43.69 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  43.69 
 
 		 313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  43.69 
 
 		 318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11610  porphobilinogen deaminase  42.95 
 
 		 318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  43.69 
 
 		 313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  43.27 
 
 		 310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  43.27 
 
 		 310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  43.27 
 
 		 310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  41.99 
 
 		 310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  41.99 
 
 		 315 aa  239  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  44.01 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  43.59 
 
 		 310 aa  239  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  42.95 
 
 		 313 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  43.32 
 
 		 308 aa  239  5.999999999999999e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05521  porphobilinogen deaminase  42.36 
 
 		 315 aa  238  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.276961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  42.63 
 
 		 309 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  46.38 
 
 		 313 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  43.37 
 
 		 320 aa  238  9e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>