More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11610 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_11610  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 318 aa  645    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  42.95 
 
 		 313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  40.45 
 
 		 309 aa  232  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2070  porphobilinogen deaminase  42.59 
 
 		 327 aa  232  7.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0208859  hitchhiker  0.0000965484 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  38.68 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  37.7 
 
 		 312 aa  229  4e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  37.46 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  38.36 
 
 		 313 aa  225  7e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  37.03 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  37.66 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  37.03 
 
 		 313 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  40.53 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  39.05 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05521  porphobilinogen deaminase  38.64 
 
 		 315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.276961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  41.5 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  39.29 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0679  porphobilinogen deaminase  39.67 
 
 		 317 aa  209  4e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.451406  normal  0.332479 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  39.48 
 
 		 316 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1828  porphobilinogen deaminase  37.99 
 
 		 315 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31592  predicted protein  39.42 
 
 		 325 aa  207  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.784447 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04951  porphobilinogen deaminase  38.31 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.334606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  39.6 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  40.2 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  39.25 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2749  porphobilinogen deaminase  38.68 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1200  porphobilinogen deaminase  39.93 
 
 		 321 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.580193  normal  0.533215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  39.34 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  39.61 
 
 		 313 aa  205  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  39.14 
 
 		 320 aa  206  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  39.23 
 
 		 309 aa  206  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1680  porphobilinogen deaminase  39.67 
 
 		 317 aa  205  7e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  40.26 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  36.57 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  38.14 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  40.79 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  36.48 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  38.64 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  38.49 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  37.17 
 
 		 318 aa  202  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0656  porphobilinogen deaminase  42.38 
 
 		 325 aa  202  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  40.32 
 
 		 310 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  37.79 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  39.41 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  39.41 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  39.03 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  39.41 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  39.41 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  39.41 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  37.22 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  39.41 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07271  porphobilinogen deaminase  38.69 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51811  hydroxymethylbilane synthase  40.99 
 
 		 329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  39.41 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  38.96 
 
 		 313 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  39.09 
 
 		 313 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  39.09 
 
 		 313 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  40.06 
 
 		 312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  37.18 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  37.14 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  40.51 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2898  porphobilinogen deaminase  37.82 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101786  normal  0.0803505 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3300  porphobilinogen deaminase  37.82 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  39.47 
 
 		 351 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3674  porphobilinogen deaminase  36.42 
 
 		 311 aa  196  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  38.31 
 
 		 313 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  38.31 
 
 		 318 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  38.31 
 
 		 313 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  38.31 
 
 		 320 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  38.31 
 
 		 320 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  39.55 
 
 		 313 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  39.2 
 
 		 313 aa  195  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  41.21 
 
 		 314 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  41.21 
 
 		 314 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0549  Hydroxymethylbilane synthase  38.83 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  0.484278 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  38.21 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  37.46 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  37.46 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  39.2 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00121  hydroxymethylbilane synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11760)  38.75 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  40.07 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0700  porphobilinogen deaminase  39.86 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  38.87 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  37.54 
 
 		 317 aa  192  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  36.18 
 
 		 318 aa  192  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  37.34 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  37.21 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  39.09 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  37.87 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  38.1 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  38.31 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  36.25 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  35.46 
 
 		 321 aa  190  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  37.74 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  36.18 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  36.54 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  36.88 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0492  hydroxymethylbilane synthase  40.32 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  36.86 
 
 		 308 aa  190  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>