More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0093 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 309 aa  609  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0353  porphobilinogen deaminase  48.87 
 
 		 294 aa  289  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0727  porphobilinogen deaminase  48.86 
 
 		 299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.275152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  46.75 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  45.7 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  45.6 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  48.03 
 
 		 303 aa  249  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  44.74 
 
 		 311 aa  249  5e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  43.79 
 
 		 322 aa  248  8e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  47.87 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  44.59 
 
 		 320 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  47.06 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  46.3 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  42.3 
 
 		 320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  43.14 
 
 		 336 aa  242  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  45.85 
 
 		 315 aa  242  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  47.5 
 
 		 320 aa  241  7.999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  46.3 
 
 		 309 aa  241  9e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  42.53 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  44.48 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  42.53 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  42.39 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  43 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  42.86 
 
 		 309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  46.08 
 
 		 309 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  46.3 
 
 		 309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  46.15 
 
 		 309 aa  239  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  46.47 
 
 		 309 aa  239  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  46.15 
 
 		 309 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  43.14 
 
 		 310 aa  238  8e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  46.15 
 
 		 309 aa  238  9e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  46.15 
 
 		 309 aa  238  9e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  46.47 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  47.19 
 
 		 309 aa  237  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  43.18 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  45.83 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  45.31 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  44.26 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  45.42 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  46.47 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  40.91 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  45.28 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  41.23 
 
 		 312 aa  236  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  45.93 
 
 		 310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  44.81 
 
 		 317 aa  235  6e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  42.53 
 
 		 313 aa  235  6e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  41.56 
 
 		 313 aa  235  8e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  41.88 
 
 		 313 aa  235  9e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  42.07 
 
 		 309 aa  235  9e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  47.08 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  45.1 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  43.04 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  43.81 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  46.23 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  45.16 
 
 		 317 aa  232  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  40.91 
 
 		 314 aa  231  9e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1702  porphobilinogen deaminase  42.24 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  40.92 
 
 		 316 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  43.18 
 
 		 309 aa  229  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  38.94 
 
 		 316 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0262  porphobilinogen deaminase  47.16 
 
 		 303 aa  229  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.207863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  46.1 
 
 		 313 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  40.59 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  44.41 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  42.02 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  43.75 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  44.81 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  43.46 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  43.46 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  43.46 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  42.02 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  45.78 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  43.46 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  43.32 
 
 		 326 aa  226  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  40.59 
 
 		 316 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  41.25 
 
 		 321 aa  226  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  42.43 
 
 		 310 aa  226  4e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  43.46 
 
 		 310 aa  226  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  43.32 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1828  porphobilinogen deaminase  41.06 
 
 		 315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  40.13 
 
 		 318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  43.79 
 
 		 313 aa  225  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  40.78 
 
 		 318 aa  225  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  43.09 
 
 		 318 aa  225  8e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  43.09 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  43.09 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  43.09 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  43.09 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  43.09 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05521  porphobilinogen deaminase  40.73 
 
 		 315 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.276961 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  43.09 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  43.09 
 
 		 320 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  43.51 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  43.09 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  44.41 
 
 		 313 aa  223  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  43.14 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  43.93 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  41.88 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  43.51 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  41.83 
 
 		 351 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>