More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51811 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_51811  hydroxymethylbilane synthase  100 
 
 		 329 aa  668    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31592  predicted protein  59.25 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.784447 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3568  porphobilinogen deaminase  55.81 
 
 		 321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2529  porphobilinogen deaminase  54.02 
 
 		 318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0406  porphobilinogen deaminase  49.51 
 
 		 311 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2704  porphobilinogen deaminase  51.79 
 
 		 347 aa  296  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0679  porphobilinogen deaminase  52.12 
 
 		 314 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0551  porphobilinogen deaminase  52.27 
 
 		 322 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2334  porphobilinogen deaminase  52.12 
 
 		 322 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.69155  normal  0.249742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5394  porphobilinogen deaminase  49.19 
 
 		 309 aa  294  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3202  porphobilinogen deaminase  50.81 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  49.19 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1732  porphobilinogen deaminase  47.9 
 
 		 318 aa  292  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0335479  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  48.87 
 
 		 309 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2966  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 330 aa  288  8e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3845  porphobilinogen deaminase  51.13 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0471  porphobilinogen deaminase  51.66 
 
 		 316 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.834743 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0975  porphobilinogen deaminase  50.16 
 
 		 314 aa  282  7.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4145  porphobilinogen deaminase  51.13 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0562  porphobilinogen deaminase  51.99 
 
 		 316 aa  279  4e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3630  porphobilinogen deaminase  51.63 
 
 		 313 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0881081  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 		 314 aa  272  7e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  49.34 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2839  porphobilinogen deaminase  48.97 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3699  porphobilinogen deaminase  49.03 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4020  porphobilinogen deaminase  48.7 
 
 		 309 aa  268  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1349  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 		 308 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751939 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  45.07 
 
 		 318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  45.07 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  45.07 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  45.07 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  45.07 
 
 		 313 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  45.07 
 
 		 320 aa  252  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  45.07 
 
 		 313 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  45.07 
 
 		 320 aa  252  6e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  45.07 
 
 		 318 aa  252  6e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  44.41 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  46.44 
 
 		 318 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  46.44 
 
 		 320 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  46.44 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  46.44 
 
 		 320 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  46.44 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0007  porphobilinogen deaminase  47.35 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000143071  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  44.69 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  44.16 
 
 		 317 aa  246  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1158  porphobilinogen deaminase  47.85 
 
 		 317 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  43.37 
 
 		 314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2898  porphobilinogen deaminase  45.04 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101786  normal  0.0803505 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3300  porphobilinogen deaminase  45.04 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  44.37 
 
 		 313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  45.76 
 
 		 309 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  44.59 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  41.75 
 
 		 309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  45.31 
 
 		 317 aa  239  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1762  porphobilinogen deaminase  42.99 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1728  porphobilinogen deaminase  42.99 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  42.12 
 
 		 310 aa  239  5e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  46.96 
 
 		 309 aa  238  8e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  44.18 
 
 		 309 aa  238  8e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  42.62 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  42.16 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  43.37 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  42.26 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  43.75 
 
 		 313 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  41.99 
 
 		 310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  44.01 
 
 		 312 aa  235  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  43.42 
 
 		 314 aa  235  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  43.75 
 
 		 313 aa  235  8e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  40.97 
 
 		 322 aa  235  8e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1234  porphobilinogen deaminase  41.08 
 
 		 308 aa  235  9e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0387484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  43.51 
 
 		 312 aa  235  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  42.31 
 
 		 318 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  43.28 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  43.75 
 
 		 313 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  45.14 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  43.46 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  44.18 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  44.93 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  43.45 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  45.3 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  41.75 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  44 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  44.75 
 
 		 310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  44.44 
 
 		 317 aa  232  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  42.21 
 
 		 306 aa  232  7.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  42.17 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  43.48 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  42.26 
 
 		 351 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  41.99 
 
 		 318 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  44 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  41.37 
 
 		 312 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  40.46 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  44.75 
 
 		 310 aa  229  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  44.75 
 
 		 310 aa  229  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  44.75 
 
 		 310 aa  229  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  44.41 
 
 		 310 aa  229  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  43.73 
 
 		 326 aa  228  9e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  42.17 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  43.73 
 
 		 315 aa  228  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  42.17 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>