More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2070 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2070  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 327 aa  638    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0208859  hitchhiker  0.0000965484 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  51.09 
 
 		 313 aa  299  4e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  45.71 
 
 		 313 aa  273  3e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  41.8 
 
 		 313 aa  266  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  43.17 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  43.61 
 
 		 313 aa  266  4e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  48.73 
 
 		 313 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  42.72 
 
 		 313 aa  265  5.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  41.32 
 
 		 312 aa  263  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  47.29 
 
 		 311 aa  262  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  44.37 
 
 		 306 aa  261  8e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  45.54 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  48.52 
 
 		 314 aa  261  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  44.79 
 
 		 309 aa  258  8e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  50.18 
 
 		 303 aa  258  9e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  44.97 
 
 		 351 aa  258  9e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  49.82 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  42.45 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0525  porphobilinogen deaminase  44.86 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  46.42 
 
 		 318 aa  256  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  43.4 
 
 		 309 aa  255  8e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  45.45 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  49.1 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  40.82 
 
 		 313 aa  252  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  45.88 
 
 		 318 aa  252  6e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  45.54 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  44.13 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  48.7 
 
 		 310 aa  250  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  45.22 
 
 		 313 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  45.22 
 
 		 313 aa  249  6e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  39.24 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  46.18 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  43.17 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  42.9 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  42.32 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  46.26 
 
 		 317 aa  245  6e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  43.95 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  43.95 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  43.95 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  43.95 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  43.95 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  42.44 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  45.25 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  43.95 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  43.95 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  44.27 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  43.95 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  42.68 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  44.27 
 
 		 320 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  44.27 
 
 		 320 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  44.27 
 
 		 313 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  44.27 
 
 		 313 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11610  porphobilinogen deaminase  42.59 
 
 		 318 aa  242  6e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  43.63 
 
 		 320 aa  242  7e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  44.3 
 
 		 317 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  44.3 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  42.72 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  40.69 
 
 		 318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  42.68 
 
 		 317 aa  239  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  45.48 
 
 		 324 aa  239  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  45.86 
 
 		 313 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  43.31 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  46.27 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1048  porphobilinogen deaminase  41.46 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0191591  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  43.31 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  44.72 
 
 		 314 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  44.05 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  43.71 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  44.27 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6800  porphobilinogen deaminase  43.6 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  43.31 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  43.22 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  44.94 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  43.4 
 
 		 310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  45.25 
 
 		 313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  43.71 
 
 		 310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  47.1 
 
 		 319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  42.28 
 
 		 311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  43.71 
 
 		 313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  46.52 
 
 		 316 aa  235  7e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  42.45 
 
 		 310 aa  235  7e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  42.45 
 
 		 310 aa  235  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  42.45 
 
 		 310 aa  235  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  43.35 
 
 		 326 aa  235  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  43.04 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  43.4 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  44.62 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  46.15 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  43.83 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  42.31 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  45.08 
 
 		 309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  43.4 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  47.43 
 
 		 313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  43.4 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  44.59 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  45.79 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  45.99 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  45.62 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  45.79 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2749  porphobilinogen deaminase  43.67 
 
 		 334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>