More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2563 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 311 aa  628  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  52.6 
 
 		 310 aa  309  5e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  52.77 
 
 		 318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  52.61 
 
 		 310 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  51.45 
 
 		 318 aa  296  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  52.32 
 
 		 306 aa  296  3e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  51.13 
 
 		 320 aa  296  4e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  51.13 
 
 		 320 aa  296  4e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  51.13 
 
 		 320 aa  296  4e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  51.13 
 
 		 320 aa  295  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  50.8 
 
 		 320 aa  295  6e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  55.05 
 
 		 312 aa  295  7e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  52.3 
 
 		 313 aa  295  9e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  50.8 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  50.8 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  51.32 
 
 		 309 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  50.8 
 
 		 318 aa  293  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0525  porphobilinogen deaminase  50.32 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  49.17 
 
 		 306 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  48.03 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  51.13 
 
 		 318 aa  289  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  49.84 
 
 		 314 aa  290  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  50.32 
 
 		 316 aa  288  8e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  51.27 
 
 		 318 aa  288  9e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  50.66 
 
 		 312 aa  287  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  51.48 
 
 		 309 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  50.65 
 
 		 317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 310 aa  286  4e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  50.97 
 
 		 313 aa  285  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 		 313 aa  285  9e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  50.16 
 
 		 315 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  51.31 
 
 		 326 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  50.82 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 318 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  48.52 
 
 		 313 aa  282  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  51.79 
 
 		 310 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  48.71 
 
 		 317 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  49.34 
 
 		 322 aa  281  8.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 309 aa  281  9e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1322  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 314 aa  281  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  49.03 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  49.04 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0764  porphobilinogen deaminase  53.99 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000120999 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  48.41 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0691  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.411778  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 313 aa  279  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  48.51 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  48.51 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  49.35 
 
 		 308 aa  279  4e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 		 313 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  50.49 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  49.03 
 
 		 317 aa  276  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 310 aa  275  5e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  48.36 
 
 		 311 aa  275  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  50.16 
 
 		 310 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  50.16 
 
 		 310 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  48.84 
 
 		 311 aa  275  8e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  50.16 
 
 		 310 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1048  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 309 aa  275  8e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0191591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 310 aa  275  9e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  46.89 
 
 		 313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  45.9 
 
 		 313 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  45.75 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 313 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  48.7 
 
 		 313 aa  273  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  49.51 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 313 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  48.21 
 
 		 313 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  48.21 
 
 		 313 aa  272  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  49.51 
 
 		 310 aa  272  6e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2232  porphobilinogen deaminase  54.44 
 
 		 312 aa  272  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495959  normal  0.0113482 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  45.9 
 
 		 312 aa  271  7e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  48.52 
 
 		 315 aa  271  7e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2890  porphobilinogen deaminase  55.47 
 
 		 320 aa  272  7e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  49.33 
 
 		 315 aa  271  8.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  48.18 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2749  porphobilinogen deaminase  47.6 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1374  porphobilinogen deaminase  51.67 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212718  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  49.19 
 
 		 312 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2377  porphobilinogen deaminase  55.06 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1715  porphobilinogen deaminase  48.87 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0767  porphobilinogen deaminase  48.2 
 
 		 308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  48.85 
 
 		 312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  48.68 
 
 		 313 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  47.88 
 
 		 313 aa  269  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  48.52 
 
 		 317 aa  269  5.9999999999999995e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 313 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  46.38 
 
 		 351 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  48.05 
 
 		 311 aa  268  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>