More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0492 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0492  hydroxymethylbilane synthase  100 
 
 		 312 aa  631  1e-180  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3276  porphobilinogen deaminase  59.08 
 
 		 307 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.541396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5018  porphobilinogen deaminase  55.37 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0963  porphobilinogen deaminase  50.66 
 
 		 310 aa  298  9e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  46.1 
 
 		 306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  45.4 
 
 		 313 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  44.22 
 
 		 311 aa  238  9e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  45.54 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  45.25 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  43.65 
 
 		 310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  45.54 
 
 		 313 aa  229  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  44.08 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  44.9 
 
 		 313 aa  226  6e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  45.78 
 
 		 318 aa  225  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  43.13 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  44.41 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  42.31 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  44.9 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  43.45 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  41.94 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  43.65 
 
 		 318 aa  220  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  44.59 
 
 		 313 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  43.32 
 
 		 309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  44.92 
 
 		 319 aa  219  6e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  43.63 
 
 		 322 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  41.67 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  43.63 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  44.37 
 
 		 316 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  42.53 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  42.58 
 
 		 316 aa  215  7e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  42.81 
 
 		 315 aa  215  9e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  43.85 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  44.66 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  41.03 
 
 		 317 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  43.97 
 
 		 309 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  41.94 
 
 		 313 aa  212  5.999999999999999e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  44.01 
 
 		 316 aa  212  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  43.59 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  41.53 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  40.91 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  42.77 
 
 		 320 aa  210  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  41.8 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  43.59 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  43.59 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  42.59 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  43.51 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  44.07 
 
 		 315 aa  209  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  41.37 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  41.64 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  42.02 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  41.8 
 
 		 320 aa  206  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  43.61 
 
 		 312 aa  206  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0035  porphobilinogen deaminase  42.02 
 
 		 310 aa  205  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  41.88 
 
 		 314 aa  205  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03640  porphobilinogen deaminase  39.74 
 
 		 305 aa  205  7e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  43.46 
 
 		 316 aa  205  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  41.48 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  41.48 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04951  porphobilinogen deaminase  42.39 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.334606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  41.48 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  44.12 
 
 		 303 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  41.69 
 
 		 308 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  41.48 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  41.48 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  41.03 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  41.48 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3674  porphobilinogen deaminase  41.18 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  42.58 
 
 		 322 aa  203  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2839  porphobilinogen deaminase  43.2 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  41.51 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1680  porphobilinogen deaminase  42.16 
 
 		 317 aa  203  4e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  42.47 
 
 		 285 aa  203  4e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  41.04 
 
 		 311 aa  202  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  41.16 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  41.42 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  39.87 
 
 		 314 aa  202  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  40.58 
 
 		 313 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  40.2 
 
 		 310 aa  202  8e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1437  porphobilinogen deaminase  41.91 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  39.67 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  40.26 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  41.56 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0525  porphobilinogen deaminase  39.81 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  43.91 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2749  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  42.77 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  42.77 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  42.62 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  39.16 
 
 		 339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  40.06 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  40.58 
 
 		 310 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  42.53 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  42.48 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07271  porphobilinogen deaminase  43.18 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2966  porphobilinogen deaminase  40.55 
 
 		 330 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1828  porphobilinogen deaminase  40.97 
 
 		 315 aa  198  9e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4145  porphobilinogen deaminase  42.96 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05521  porphobilinogen deaminase  41.23 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.276961 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  39.17 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  40.06 
 
 		 309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>