More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5018 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5018  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 309 aa  620  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3276  porphobilinogen deaminase  63.43 
 
 		 307 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.541396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0492  hydroxymethylbilane synthase  55.37 
 
 		 312 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0963  porphobilinogen deaminase  52.1 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  43.51 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  46.95 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  43.87 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  44.69 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  44.84 
 
 		 309 aa  235  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  45.19 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  43.18 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  43.14 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  43.32 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  43.18 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  42.53 
 
 		 318 aa  225  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  43.65 
 
 		 315 aa  222  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  42.53 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  43.95 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  41.23 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  41.56 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  42.04 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  41.56 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  41.88 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1680  porphobilinogen deaminase  44.16 
 
 		 317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  42.21 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0679  porphobilinogen deaminase  43.04 
 
 		 317 aa  217  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.451406  normal  0.332479 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  41.88 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  42.21 
 
 		 351 aa  215  7e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  43.89 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  41.56 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  43.46 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  42.81 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  42.05 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  42.54 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  43.14 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  40.2 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  40.58 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  41.16 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  41.67 
 
 		 320 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  41.67 
 
 		 320 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  40.98 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  44.3 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  40.52 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  44.19 
 
 		 300 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  41.84 
 
 		 285 aa  209  5e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07271  porphobilinogen deaminase  41.8 
 
 		 317 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04951  porphobilinogen deaminase  41.61 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.334606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  42.21 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  41.03 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  43.56 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  41.23 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  39.68 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  41.5 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  40.84 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  41.99 
 
 		 320 aa  206  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0767  porphobilinogen deaminase  40.33 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  42.24 
 
 		 309 aa  205  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  45.02 
 
 		 315 aa  205  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  42.17 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  40.91 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  41.18 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  39.81 
 
 		 317 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  41.06 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  42.05 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  41.58 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  40.4 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  39.87 
 
 		 316 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1999  porphobilinogen deaminase  41.47 
 
 		 318 aa  202  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  decreased coverage  0.0000671123 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  38.26 
 
 		 313 aa  202  7e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  40.73 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  41.94 
 
 		 311 aa  202  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  41.72 
 
 		 313 aa  201  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  40.19 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  40.85 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  39.35 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  38.73 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  41.25 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0035  porphobilinogen deaminase  42.05 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0525  porphobilinogen deaminase  40.07 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  42.09 
 
 		 336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  41.46 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  44.01 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  41.39 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  41.39 
 
 		 313 aa  199  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  41.45 
 
 		 313 aa  199  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  38.36 
 
 		 308 aa  199  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  42.48 
 
 		 326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  40.52 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  40.52 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  40.52 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  40.52 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  40.52 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  40.52 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  40.52 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  38.71 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  40.19 
 
 		 310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  41.12 
 
 		 313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  40.07 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2898  porphobilinogen deaminase  41.73 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101786  normal  0.0803505 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  41.12 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>