More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0767 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0767  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 311 aa  627  1e-179  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1048  porphobilinogen deaminase  77.02 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0191591  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0691  porphobilinogen deaminase  67.21 
 
 		 303 aa  409  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.411778  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  63.75 
 
 		 308 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1322  porphobilinogen deaminase  63.75 
 
 		 314 aa  393  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0649  porphobilinogen deaminase  61.69 
 
 		 307 aa  384  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.485602  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0570  porphobilinogen deaminase  61.69 
 
 		 307 aa  384  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0767  porphobilinogen deaminase  61.31 
 
 		 308 aa  385  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1385  porphobilinogen deaminase  61.36 
 
 		 307 aa  379  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  60.19 
 
 		 313 aa  374  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  53.11 
 
 		 313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  53.14 
 
 		 317 aa  302  4.0000000000000003e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  52.98 
 
 		 318 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  52.65 
 
 		 320 aa  301  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  52.65 
 
 		 313 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  52.65 
 
 		 313 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  52.65 
 
 		 318 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  52.65 
 
 		 320 aa  301  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  52.98 
 
 		 313 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  52.98 
 
 		 320 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  52.98 
 
 		 320 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  52.98 
 
 		 320 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  52.98 
 
 		 313 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  52.98 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  52.98 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  52.65 
 
 		 322 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  52.98 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  53.14 
 
 		 312 aa  299  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  51.32 
 
 		 313 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  51.32 
 
 		 313 aa  298  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  52.48 
 
 		 312 aa  298  6e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  51.66 
 
 		 313 aa  296  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  50.99 
 
 		 313 aa  295  5e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  52.63 
 
 		 313 aa  295  6e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  50.99 
 
 		 310 aa  295  6e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  51.32 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  51.99 
 
 		 326 aa  293  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  52.46 
 
 		 317 aa  292  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  51.64 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  52.15 
 
 		 311 aa  289  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  49.19 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  52.79 
 
 		 315 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  50.66 
 
 		 309 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  50.17 
 
 		 312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  52.48 
 
 		 310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  52.48 
 
 		 310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  52.48 
 
 		 310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  52.48 
 
 		 310 aa  286  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  52.48 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  47.68 
 
 		 318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  51.97 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  49.18 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  51.97 
 
 		 310 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  51.97 
 
 		 310 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 313 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  48.68 
 
 		 309 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  51.64 
 
 		 310 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 351 aa  281  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  49.34 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  48 
 
 		 315 aa  278  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  48.84 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  46.67 
 
 		 318 aa  275  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  49.83 
 
 		 313 aa  275  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  47.45 
 
 		 321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  47.87 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  49.18 
 
 		 315 aa  271  7e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  48.83 
 
 		 326 aa  271  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  45.9 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  47.4 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  49.32 
 
 		 315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  48.5 
 
 		 310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  48.84 
 
 		 312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  45.9 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  45.9 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  47.19 
 
 		 310 aa  268  7e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  44.88 
 
 		 318 aa  268  7e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  47.4 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  47.54 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0061  porphobilinogen deaminase  46.23 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  47.84 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  47.84 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  48.55 
 
 		 316 aa  265  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  46.73 
 
 		 311 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  46.1 
 
 		 313 aa  265  7e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  46.2 
 
 		 314 aa  265  7e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  46.08 
 
 		 313 aa  265  8e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  48 
 
 		 314 aa  264  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  47.04 
 
 		 311 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  44.88 
 
 		 318 aa  264  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  47.18 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  47.33 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  46.1 
 
 		 317 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  46.89 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  44.55 
 
 		 318 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  46.51 
 
 		 313 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  44.52 
 
 		 310 aa  262  6e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  47.42 
 
 		 310 aa  261  8.999999999999999e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  45.54 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>