More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3548 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 300 aa  588  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  67.22 
 
 		 303 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  65.99 
 
 		 303 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  49.66 
 
 		 317 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  49.16 
 
 		 309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  47.19 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 311 aa  272  6e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  48.99 
 
 		 312 aa  271  9e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  48.32 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 314 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 313 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  47.65 
 
 		 310 aa  267  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  48 
 
 		 314 aa  266  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  47.65 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  48.32 
 
 		 312 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  49.16 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  49.16 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  49.16 
 
 		 322 aa  265  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  48.33 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  48.33 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  48.33 
 
 		 318 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  48.33 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  46.49 
 
 		 309 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  48.33 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  48.33 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  49.33 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  49 
 
 		 326 aa  263  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  47.33 
 
 		 318 aa  262  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  46.49 
 
 		 310 aa  262  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 		 320 aa  262  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  47.33 
 
 		 320 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  47.51 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  47.33 
 
 		 313 aa  262  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  48.24 
 
 		 324 aa  262  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  47.33 
 
 		 313 aa  262  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  48.33 
 
 		 309 aa  262  6e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  47.33 
 
 		 320 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  44.04 
 
 		 313 aa  262  6.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  47.33 
 
 		 320 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  47.33 
 
 		 320 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  48 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  48.32 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  47.33 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  49 
 
 		 313 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  48.33 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  47 
 
 		 320 aa  259  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  47.54 
 
 		 317 aa  258  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  48.84 
 
 		 306 aa  258  9e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  47.16 
 
 		 320 aa  257  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  47.33 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  47 
 
 		 310 aa  256  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  47 
 
 		 310 aa  256  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  47 
 
 		 310 aa  256  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  47.33 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  47 
 
 		 310 aa  255  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  49.66 
 
 		 309 aa  256  5e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05521  porphobilinogen deaminase  47.54 
 
 		 315 aa  254  9e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.276961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  46.69 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  47.02 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  43.05 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  46.67 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  43.05 
 
 		 312 aa  253  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  46.67 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  44.52 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  46.67 
 
 		 313 aa  253  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  46.67 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  46.67 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  47.33 
 
 		 313 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  46.67 
 
 		 313 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  46.67 
 
 		 322 aa  252  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  47.33 
 
 		 313 aa  252  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  45.36 
 
 		 318 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  47.33 
 
 		 313 aa  251  9.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  47.67 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1828  porphobilinogen deaminase  46.89 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  46.33 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1225  porphobilinogen deaminase  47.84 
 
 		 305 aa  250  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3530  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  47.32 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  44.82 
 
 		 318 aa  249  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  45.15 
 
 		 318 aa  249  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04137  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 304 aa  249  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.870517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  48 
 
 		 311 aa  250  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  42.05 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  48.17 
 
 		 310 aa  249  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  46.6 
 
 		 326 aa  248  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  41.39 
 
 		 313 aa  248  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  45.48 
 
 		 322 aa  248  7e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  42.05 
 
 		 313 aa  248  7e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  45.33 
 
 		 351 aa  248  9e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0679  porphobilinogen deaminase  48.01 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.451406  normal  0.332479 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  47.33 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  47.02 
 
 		 319 aa  246  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1258  porphobilinogen deaminase  47.84 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  44.15 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  45.51 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  42.05 
 
 		 313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  45.18 
 
 		 304 aa  245  8e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0525  porphobilinogen deaminase  45.85 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>