More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2690 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2690  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 321 aa  647    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  65.02 
 
 		 306 aa  381  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0035  porphobilinogen deaminase  65.69 
 
 		 310 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3674  porphobilinogen deaminase  63.04 
 
 		 311 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2571  porphobilinogen deaminase  61.83 
 
 		 338 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1069  porphobilinogen deaminase  62.82 
 
 		 342 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2749  porphobilinogen deaminase  58.9 
 
 		 334 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2166  porphobilinogen deaminase  61.2 
 
 		 338 aa  359  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.600756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1437  porphobilinogen deaminase  61.04 
 
 		 310 aa  358  7e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0700  porphobilinogen deaminase  59.81 
 
 		 334 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2357  porphobilinogen deaminase  61.59 
 
 		 334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206721  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2179  porphobilinogen deaminase  62.46 
 
 		 327 aa  352  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.230446  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  59.74 
 
 		 313 aa  346  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1200  porphobilinogen deaminase  57.93 
 
 		 321 aa  345  7e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.580193  normal  0.533215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  58.17 
 
 		 326 aa  344  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  57.14 
 
 		 309 aa  344  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0872  porphobilinogen deaminase  67.53 
 
 		 329 aa  342  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  58.42 
 
 		 308 aa  341  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0869  porphobilinogen deaminase  62.87 
 
 		 402 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326995  normal  0.554351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  58.42 
 
 		 313 aa  340  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0656  porphobilinogen deaminase  57.52 
 
 		 325 aa  340  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5752  porphobilinogen deaminase  61.89 
 
 		 334 aa  339  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2429  porphobilinogen deaminase  61.89 
 
 		 334 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.237637 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1813  porphobilinogen deaminase  61.89 
 
 		 334 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.57316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2425  porphobilinogen deaminase  61.89 
 
 		 403 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2468  porphobilinogen deaminase  60.45 
 
 		 328 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  53.42 
 
 		 351 aa  334  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  55.84 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0730  porphobilinogen deaminase  67.66 
 
 		 329 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1229  porphobilinogen deaminase  67.66 
 
 		 329 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3000  porphobilinogen deaminase  67.66 
 
 		 329 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2284  porphobilinogen deaminase  67.66 
 
 		 329 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1071  porphobilinogen deaminase  67.66 
 
 		 329 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1597  porphobilinogen deaminase  67.66 
 
 		 329 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1077  porphobilinogen deaminase  67.66 
 
 		 329 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.941716  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  57.76 
 
 		 313 aa  333  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  58.8 
 
 		 313 aa  333  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  55.84 
 
 		 312 aa  332  6e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  56.41 
 
 		 313 aa  331  8e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  55.56 
 
 		 326 aa  331  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  55.3 
 
 		 310 aa  331  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  56.09 
 
 		 313 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  55.84 
 
 		 319 aa  329  4e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  57.48 
 
 		 318 aa  328  6e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  57.43 
 
 		 322 aa  328  7e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2890  porphobilinogen deaminase  65.78 
 
 		 320 aa  328  7e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  57.48 
 
 		 313 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  57.48 
 
 		 320 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  57.48 
 
 		 320 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  57.48 
 
 		 313 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2377  porphobilinogen deaminase  65.78 
 
 		 310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  57.48 
 
 		 320 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  57.14 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  57.14 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  54.49 
 
 		 312 aa  326  3e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  54.37 
 
 		 310 aa  326  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  53.7 
 
 		 317 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  56.81 
 
 		 320 aa  325  5e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  54.49 
 
 		 313 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  54.98 
 
 		 312 aa  325  7e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  57.33 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  57.33 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  55.08 
 
 		 315 aa  324  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  57.14 
 
 		 318 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  55.23 
 
 		 309 aa  324  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  57.14 
 
 		 313 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  57.14 
 
 		 313 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  53.97 
 
 		 317 aa  323  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  54.82 
 
 		 310 aa  322  5e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  53.72 
 
 		 313 aa  322  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  56.58 
 
 		 313 aa  322  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2334  porphobilinogen deaminase  61.77 
 
 		 304 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.350686 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  56.25 
 
 		 313 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1715  porphobilinogen deaminase  57.24 
 
 		 315 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  54.85 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  53.4 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  56.58 
 
 		 313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  54.1 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  53.72 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  56.67 
 
 		 313 aa  319  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  53.4 
 
 		 310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  53.4 
 
 		 310 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  53.4 
 
 		 310 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  54.88 
 
 		 313 aa  319  5e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  54.55 
 
 		 309 aa  318  6e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  53.53 
 
 		 313 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  53.21 
 
 		 313 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  54.05 
 
 		 313 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2232  porphobilinogen deaminase  64.2 
 
 		 312 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495959  normal  0.0113482 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  53.07 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  53.07 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  53.07 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  57.72 
 
 		 311 aa  315  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  53.04 
 
 		 317 aa  315  5e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  52.88 
 
 		 313 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  52.75 
 
 		 310 aa  315  7e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  53.4 
 
 		 313 aa  315  8e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  55.78 
 
 		 308 aa  315  8e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  53.05 
 
 		 314 aa  315  8e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3411  porphobilinogen deaminase  65.04 
 
 		 285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>