More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0975 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0975  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 314 aa  624  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  84.08 
 
 		 314 aa  535  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  83.55 
 
 		 304 aa  514  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3202  porphobilinogen deaminase  68.18 
 
 		 309 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3699  porphobilinogen deaminase  64.72 
 
 		 309 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2966  porphobilinogen deaminase  64.94 
 
 		 330 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4020  porphobilinogen deaminase  63.11 
 
 		 309 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4145  porphobilinogen deaminase  62.66 
 
 		 309 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1349  porphobilinogen deaminase  59.14 
 
 		 308 aa  326  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751939 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0551  porphobilinogen deaminase  58.42 
 
 		 322 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2704  porphobilinogen deaminase  56.54 
 
 		 347 aa  315  4e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2334  porphobilinogen deaminase  57.43 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.69155  normal  0.249742 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0562  porphobilinogen deaminase  55.48 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0679  porphobilinogen deaminase  57.1 
 
 		 314 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1158  porphobilinogen deaminase  56.61 
 
 		 317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0471  porphobilinogen deaminase  55.16 
 
 		 316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.834743 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3845  porphobilinogen deaminase  55.05 
 
 		 318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3630  porphobilinogen deaminase  54.79 
 
 		 313 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0881081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5394  porphobilinogen deaminase  54.82 
 
 		 309 aa  295  5e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3568  porphobilinogen deaminase  52.04 
 
 		 321 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2529  porphobilinogen deaminase  54.72 
 
 		 318 aa  292  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  54.49 
 
 		 309 aa  291  9e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  53.82 
 
 		 309 aa  288  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51811  hydroxymethylbilane synthase  50.16 
 
 		 329 aa  282  6.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1732  porphobilinogen deaminase  51.16 
 
 		 318 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0335479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0406  porphobilinogen deaminase  51.5 
 
 		 311 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  47.3 
 
 		 314 aa  272  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0007  porphobilinogen deaminase  53.59 
 
 		 337 aa  271  7e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000143071  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2839  porphobilinogen deaminase  51.9 
 
 		 307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  49.14 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  46.28 
 
 		 317 aa  266  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  46.51 
 
 		 317 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  45.93 
 
 		 310 aa  261  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  45.82 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  44.95 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  46.58 
 
 		 309 aa  260  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  47.32 
 
 		 351 aa  259  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0118  porphobilinogen deaminase  49.52 
 
 		 318 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  44.77 
 
 		 326 aa  259  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  44.77 
 
 		 309 aa  257  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  47.08 
 
 		 312 aa  256  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  45.75 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  45.75 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  45.75 
 
 		 310 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  45.75 
 
 		 310 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  46.84 
 
 		 313 aa  256  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  43.73 
 
 		 315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  44.77 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  46.51 
 
 		 313 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  44.77 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  44.77 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  44.77 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  45.1 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  46.84 
 
 		 313 aa  252  6e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  47.52 
 
 		 303 aa  252  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31592  predicted protein  47.77 
 
 		 325 aa  251  8.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.784447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  44.92 
 
 		 315 aa  251  9.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  47.08 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  47.75 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  45.7 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  45.92 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  47.93 
 
 		 315 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  42.95 
 
 		 310 aa  249  3e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  46.6 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  44.01 
 
 		 317 aa  249  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  45.21 
 
 		 313 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  45.21 
 
 		 313 aa  248  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  46.6 
 
 		 313 aa  248  9e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  45.73 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  45.18 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1715  porphobilinogen deaminase  48.32 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  47.19 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  44.52 
 
 		 313 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  43.33 
 
 		 318 aa  245  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  44.78 
 
 		 322 aa  245  6e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  45.92 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  47.8 
 
 		 306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  46.84 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  45.89 
 
 		 326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  45.18 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  44.44 
 
 		 306 aa  243  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  45.03 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  45.18 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  45.7 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  44.52 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  42.86 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  44.52 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  44.52 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  45.55 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  45.58 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  44.85 
 
 		 318 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  44.52 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  44.52 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  44.55 
 
 		 311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  44.52 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  44.52 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  44.71 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  44.52 
 
 		 320 aa  239  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0061  porphobilinogen deaminase  45.27 
 
 		 311 aa  239  5e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  43.79 
 
 		 309 aa  238  6.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>