More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1158 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1158  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 317 aa  613  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0975  porphobilinogen deaminase  56.61 
 
 		 314 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0471  porphobilinogen deaminase  61.19 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.834743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3202  porphobilinogen deaminase  56.23 
 
 		 309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0562  porphobilinogen deaminase  60.45 
 
 		 316 aa  305  7e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  54.92 
 
 		 314 aa  305  9.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2704  porphobilinogen deaminase  54.07 
 
 		 347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  54.58 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0551  porphobilinogen deaminase  53.25 
 
 		 322 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0007  porphobilinogen deaminase  58.33 
 
 		 337 aa  295  7e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000143071  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0679  porphobilinogen deaminase  52.6 
 
 		 314 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2966  porphobilinogen deaminase  51.86 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2334  porphobilinogen deaminase  52.6 
 
 		 322 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.69155  normal  0.249742 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2529  porphobilinogen deaminase  53.38 
 
 		 318 aa  282  6.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3699  porphobilinogen deaminase  50.85 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3845  porphobilinogen deaminase  51.94 
 
 		 318 aa  275  5e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1732  porphobilinogen deaminase  52.82 
 
 		 318 aa  275  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0335479  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3630  porphobilinogen deaminase  52.98 
 
 		 313 aa  275  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0881081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4020  porphobilinogen deaminase  50.51 
 
 		 309 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3568  porphobilinogen deaminase  53.33 
 
 		 321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0406  porphobilinogen deaminase  53 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4145  porphobilinogen deaminase  50.51 
 
 		 309 aa  271  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  53.54 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  53.54 
 
 		 309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5394  porphobilinogen deaminase  53.69 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2839  porphobilinogen deaminase  54.01 
 
 		 307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1349  porphobilinogen deaminase  51.85 
 
 		 308 aa  258  7e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  48.81 
 
 		 314 aa  258  8e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31592  predicted protein  48.36 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.784447 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51811  hydroxymethylbilane synthase  48.84 
 
 		 329 aa  256  5e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  49.48 
 
 		 313 aa  248  7e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  49.48 
 
 		 313 aa  248  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  49.13 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  46.44 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0128  porphobilinogen deaminase  52.6 
 
 		 333 aa  245  6e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  48.81 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  46.1 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  46.42 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  46.96 
 
 		 318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  48.34 
 
 		 308 aa  242  7e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  45.18 
 
 		 309 aa  242  7e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  46.88 
 
 		 318 aa  241  9e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  48.63 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  50.56 
 
 		 322 aa  239  5e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  47.32 
 
 		 310 aa  239  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  49.25 
 
 		 351 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  48.6 
 
 		 313 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  46.52 
 
 		 285 aa  237  2e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  48.25 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  45.89 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  45.51 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  46.85 
 
 		 313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  48.31 
 
 		 306 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  49.65 
 
 		 310 aa  235  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 318 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 320 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 320 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  46.85 
 
 		 313 aa  235  7e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  45.18 
 
 		 310 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  45.18 
 
 		 310 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  45.18 
 
 		 310 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  46.74 
 
 		 311 aa  235  9e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  48.46 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 313 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 313 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1936  porphobilinogen deaminase  51.08 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0833928  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  44.85 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  44.85 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  44.85 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  44.85 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  47.2 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0040  porphobilinogen deaminase  54.68 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  46.18 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  45.76 
 
 		 317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  43.94 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  46.18 
 
 		 310 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  46.37 
 
 		 310 aa  232  8.000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  47.45 
 
 		 315 aa  231  9e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  47.22 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  48.96 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  48.25 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1838  porphobilinogen deaminase  54.89 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2070  porphobilinogen deaminase  51.49 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0208859  hitchhiker  0.0000965484 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  44.85 
 
 		 310 aa  229  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  45.8 
 
 		 317 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  47.57 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  46.76 
 
 		 310 aa  228  7e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  48.42 
 
 		 313 aa  229  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  51.34 
 
 		 315 aa  228  9e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  46.69 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  45.1 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  48.69 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  48.77 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  47.06 
 
 		 312 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  48.13 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  46.76 
 
 		 312 aa  226  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  47.19 
 
 		 312 aa  227  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  48.15 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  48.13 
 
 		 318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  45.39 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>