More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1887 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 314 aa  625  1e-178  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  99.67 
 
 		 304 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0975  porphobilinogen deaminase  84.08 
 
 		 314 aa  535  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3202  porphobilinogen deaminase  65.37 
 
 		 309 aa  401  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4020  porphobilinogen deaminase  64.65 
 
 		 309 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3699  porphobilinogen deaminase  64.01 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2966  porphobilinogen deaminase  63.58 
 
 		 330 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4145  porphobilinogen deaminase  61.34 
 
 		 309 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1349  porphobilinogen deaminase  57.81 
 
 		 308 aa  321  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0562  porphobilinogen deaminase  56.45 
 
 		 316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0551  porphobilinogen deaminase  56.25 
 
 		 322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0471  porphobilinogen deaminase  55.48 
 
 		 316 aa  301  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.834743 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2334  porphobilinogen deaminase  55.59 
 
 		 322 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.69155  normal  0.249742 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0679  porphobilinogen deaminase  55.26 
 
 		 314 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3568  porphobilinogen deaminase  53.46 
 
 		 321 aa  296  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1158  porphobilinogen deaminase  54.92 
 
 		 317 aa  295  6e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2704  porphobilinogen deaminase  53.27 
 
 		 347 aa  289  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  52.82 
 
 		 309 aa  286  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3630  porphobilinogen deaminase  53.8 
 
 		 313 aa  285  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0881081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  52.49 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3845  porphobilinogen deaminase  52.6 
 
 		 318 aa  278  8e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  48.87 
 
 		 317 aa  278  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5394  porphobilinogen deaminase  51.83 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2529  porphobilinogen deaminase  52.09 
 
 		 318 aa  276  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  47.45 
 
 		 326 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51811  hydroxymethylbilane synthase  49.67 
 
 		 329 aa  272  7e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1732  porphobilinogen deaminase  48.69 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0335479  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  48.21 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  48.34 
 
 		 310 aa  269  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  47.23 
 
 		 309 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31592  predicted protein  50.16 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.784447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0406  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 311 aa  266  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  46.62 
 
 		 314 aa  266  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  46.73 
 
 		 309 aa  265  7e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  48.45 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  47.84 
 
 		 310 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  45.66 
 
 		 315 aa  262  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0007  porphobilinogen deaminase  53.11 
 
 		 337 aa  261  6.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000143071  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  46.92 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  48.99 
 
 		 351 aa  260  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  48.51 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2839  porphobilinogen deaminase  50.17 
 
 		 307 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  47.51 
 
 		 310 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  47.51 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  47.51 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  48.18 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  48.11 
 
 		 312 aa  258  7e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  46.51 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  46.51 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  46.51 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  46.51 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0118  porphobilinogen deaminase  50.48 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  46.51 
 
 		 310 aa  256  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  47.78 
 
 		 310 aa  255  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  47.42 
 
 		 312 aa  255  6e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  47.78 
 
 		 318 aa  255  9e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  47.32 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  45.67 
 
 		 318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  45.89 
 
 		 318 aa  252  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  48.98 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  47.62 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  48.5 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  48.11 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  48.81 
 
 		 313 aa  249  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1715  porphobilinogen deaminase  50.17 
 
 		 315 aa  249  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  48.11 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  45.82 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  47.44 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  45.18 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  47.06 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  49.31 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  46.46 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  45.51 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  45.27 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  43.43 
 
 		 306 aa  245  6e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  48.42 
 
 		 310 aa  245  9e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  47.42 
 
 		 326 aa  245  9e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  46.71 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  47.02 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  45.36 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  48.03 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  46.96 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2898  porphobilinogen deaminase  49.82 
 
 		 306 aa  242  5e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101786  normal  0.0803505 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3300  porphobilinogen deaminase  49.82 
 
 		 306 aa  242  5e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  47.96 
 
 		 313 aa  242  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  46.08 
 
 		 313 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  46.53 
 
 		 313 aa  241  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  44.59 
 
 		 318 aa  241  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  49.81 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2232  porphobilinogen deaminase  48.46 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495959  normal  0.0113482 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  46.78 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  49.43 
 
 		 313 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  46.21 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1728  porphobilinogen deaminase  44.22 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  47.64 
 
 		 320 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  47.64 
 
 		 318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  47.64 
 
 		 320 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1762  porphobilinogen deaminase  44.22 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  45.64 
 
 		 309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0764  porphobilinogen deaminase  47.19 
 
 		 322 aa  239  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000120999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>