More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3202 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3202  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 309 aa  610  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0975  porphobilinogen deaminase  68.18 
 
 		 314 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  65.37 
 
 		 314 aa  401  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  66.45 
 
 		 304 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2966  porphobilinogen deaminase  65.7 
 
 		 330 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3699  porphobilinogen deaminase  62.34 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4020  porphobilinogen deaminase  61.69 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4145  porphobilinogen deaminase  61.49 
 
 		 309 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0471  porphobilinogen deaminase  61.64 
 
 		 316 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.834743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0562  porphobilinogen deaminase  61.97 
 
 		 316 aa  325  5e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2704  porphobilinogen deaminase  56.77 
 
 		 347 aa  319  3e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2334  porphobilinogen deaminase  57.38 
 
 		 322 aa  315  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.69155  normal  0.249742 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0551  porphobilinogen deaminase  56.72 
 
 		 322 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0679  porphobilinogen deaminase  57.05 
 
 		 314 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2529  porphobilinogen deaminase  57.38 
 
 		 318 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3630  porphobilinogen deaminase  56.58 
 
 		 313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0881081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1349  porphobilinogen deaminase  55.3 
 
 		 308 aa  302  5.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751939 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3845  porphobilinogen deaminase  54.72 
 
 		 318 aa  297  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1158  porphobilinogen deaminase  56.23 
 
 		 317 aa  295  9e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51811  hydroxymethylbilane synthase  50.81 
 
 		 329 aa  293  2e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1732  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0335479  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3568  porphobilinogen deaminase  50.81 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0406  porphobilinogen deaminase  51.16 
 
 		 311 aa  279  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  52.16 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5394  porphobilinogen deaminase  51.83 
 
 		 309 aa  275  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  51.5 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0007  porphobilinogen deaminase  52.94 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000143071  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31592  predicted protein  48.06 
 
 		 325 aa  265  8.999999999999999e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.784447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0118  porphobilinogen deaminase  50.32 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2839  porphobilinogen deaminase  50.7 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  46.42 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  46.42 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  43.23 
 
 		 314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  44.67 
 
 		 285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  43.23 
 
 		 309 aa  239  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  43.67 
 
 		 306 aa  238  6.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  46.21 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0542  porphobilinogen deaminase  42.23 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0630058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  43.6 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  47.55 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  44.29 
 
 		 318 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  47.41 
 
 		 318 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  44.83 
 
 		 310 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  45.63 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  46.89 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  44.44 
 
 		 310 aa  231  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  41.87 
 
 		 310 aa  229  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  45.07 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  46.84 
 
 		 312 aa  229  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  43.85 
 
 		 310 aa  229  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  45.67 
 
 		 313 aa  228  7e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  44.98 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  45.69 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  47.04 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  45.79 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  46.47 
 
 		 351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  44.98 
 
 		 318 aa  225  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  44.64 
 
 		 309 aa  225  7e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  44.64 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  44.64 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  44.64 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  44.04 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  44.64 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  44.64 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  44.64 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  46.64 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  44.64 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0061  porphobilinogen deaminase  45.56 
 
 		 311 aa  223  2e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  44.64 
 
 		 320 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  42.57 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  42.19 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  44.64 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3300  porphobilinogen deaminase  47.76 
 
 		 306 aa  222  7e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2898  porphobilinogen deaminase  47.76 
 
 		 306 aa  222  7e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101786  normal  0.0803505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6800  porphobilinogen deaminase  42.81 
 
 		 320 aa  222  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1762  porphobilinogen deaminase  40.82 
 
 		 308 aa  222  8e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1728  porphobilinogen deaminase  40.82 
 
 		 308 aa  222  8e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0354  porphobilinogen deaminase  42.18 
 
 		 298 aa  221  9e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  41.89 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  43.42 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0040  porphobilinogen deaminase  49.34 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  43.6 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  43.85 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  45.07 
 
 		 315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  44.83 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  41.72 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  42.91 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  44.29 
 
 		 313 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  43.25 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  42.61 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  44.74 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  44.95 
 
 		 316 aa  219  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  43.05 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  43.21 
 
 		 308 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  43.25 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  43.6 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  43.6 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  43.6 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  43.6 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  43.6 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>