More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1422 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1422  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 291 aa  581  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.168494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1688  porphobilinogen deaminase  99.31 
 
 		 291 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.814141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  48.81 
 
 		 318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  45.02 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  43.43 
 
 		 311 aa  229  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  46.05 
 
 		 310 aa  229  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  48.44 
 
 		 309 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  47.44 
 
 		 318 aa  228  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  46.42 
 
 		 318 aa  227  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0764  porphobilinogen deaminase  48.02 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000120999 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  43.96 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  43.34 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  44.44 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  43.05 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  46.76 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  45.52 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  42.27 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  42.42 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  42.81 
 
 		 303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3530  porphobilinogen deaminase  43.39 
 
 		 303 aa  222  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  43.6 
 
 		 303 aa  221  8e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  45.62 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  46.88 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1999  porphobilinogen deaminase  49 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  decreased coverage  0.0000671123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  46.21 
 
 		 318 aa  219  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  47.22 
 
 		 309 aa  218  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0318  porphobilinogen deaminase  41.44 
 
 		 299 aa  218  7e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  44.83 
 
 		 320 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  44.83 
 
 		 320 aa  218  7.999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  44.83 
 
 		 320 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  44.83 
 
 		 320 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  44.83 
 
 		 318 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  46.21 
 
 		 312 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  43.06 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  43.1 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04137  porphobilinogen deaminase  42.96 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.870517  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  42.01 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2232  porphobilinogen deaminase  46.69 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495959  normal  0.0113482 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  44.83 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  44.83 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  44.83 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  46.53 
 
 		 317 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  43.06 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  46.67 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  45.24 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  44.48 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  45.17 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  43.64 
 
 		 309 aa  215  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2890  porphobilinogen deaminase  46.12 
 
 		 320 aa  215  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  46.27 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1198  porphobilinogen deaminase  40.28 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  44.33 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  44.33 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  46.18 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  41.32 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  41.32 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  45.55 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  45.86 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  45.88 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  45.49 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  44.29 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2377  porphobilinogen deaminase  46.12 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  45.88 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3002  hydroxymethylbilane synthase  44.2 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00423817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  48.44 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  45.88 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  45.88 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1322  porphobilinogen deaminase  43.15 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  46.99 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  45.88 
 
 		 309 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  45.06 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  45.49 
 
 		 309 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  44.37 
 
 		 306 aa  212  7e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  43.06 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  45.49 
 
 		 309 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  45.49 
 
 		 309 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  44.66 
 
 		 311 aa  212  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3664  porphobilinogen deaminase  47.98 
 
 		 334 aa  211  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  44.48 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  44.48 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  44.48 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  44.48 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  44.48 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  43.45 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  42.47 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0525  porphobilinogen deaminase  41.38 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  43.99 
 
 		 313 aa  209  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  44.1 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  43.75 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1225  porphobilinogen deaminase  40.69 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  43.3 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  44.48 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1258  porphobilinogen deaminase  40.69 
 
 		 305 aa  209  6e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  44.29 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  41.38 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1374  porphobilinogen deaminase  47.58 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212718  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  44.71 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  42.07 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3090  porphobilinogen deaminase  46.53 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  44.03 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>