More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1225 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1225  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 305 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1258  porphobilinogen deaminase  98.69 
 
 		 305 aa  592  1e-168  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04137  porphobilinogen deaminase  72.28 
 
 		 304 aa  423  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.870517  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3530  porphobilinogen deaminase  70.43 
 
 		 303 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  54.15 
 
 		 310 aa  308  9e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  55.03 
 
 		 351 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  54.15 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  54.15 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  54.15 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  53.64 
 
 		 317 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  53.97 
 
 		 315 aa  305  6e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  56.21 
 
 		 315 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  53.49 
 
 		 310 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  54.18 
 
 		 310 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  53.16 
 
 		 310 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  54.64 
 
 		 310 aa  301  6.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  53.16 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  53.16 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  53.49 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  53.16 
 
 		 310 aa  299  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  54.3 
 
 		 313 aa  299  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  53.16 
 
 		 310 aa  299  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  53 
 
 		 317 aa  298  6e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  52.82 
 
 		 310 aa  298  7e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  55.19 
 
 		 314 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  54.3 
 
 		 313 aa  297  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  52.65 
 
 		 309 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  52.16 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  53.49 
 
 		 322 aa  296  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  53.44 
 
 		 316 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  53.51 
 
 		 308 aa  295  7e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  54.64 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  53.16 
 
 		 309 aa  294  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  52 
 
 		 312 aa  293  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  53.16 
 
 		 313 aa  292  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  53.69 
 
 		 313 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  53.82 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  53.82 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  53.16 
 
 		 313 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  53.51 
 
 		 313 aa  288  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  53.36 
 
 		 313 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  52.82 
 
 		 313 aa  288  9e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  52.35 
 
 		 309 aa  288  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  50.17 
 
 		 310 aa  287  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  53.16 
 
 		 313 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  52.67 
 
 		 320 aa  286  4e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  52.98 
 
 		 319 aa  286  4e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  52.33 
 
 		 318 aa  285  8e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  52.33 
 
 		 320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  52.33 
 
 		 320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  52.33 
 
 		 320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  52.33 
 
 		 320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  52.33 
 
 		 318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  53.36 
 
 		 313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  52 
 
 		 313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  53.36 
 
 		 313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  52 
 
 		 313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  50.67 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  52.3 
 
 		 311 aa  279  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  50.17 
 
 		 312 aa  279  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  51.66 
 
 		 313 aa  279  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  49.34 
 
 		 308 aa  279  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 321 aa  279  5e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  52 
 
 		 320 aa  278  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  52 
 
 		 320 aa  278  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  52 
 
 		 313 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  52 
 
 		 318 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  52 
 
 		 313 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  51.66 
 
 		 313 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  51.66 
 
 		 313 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  51.01 
 
 		 317 aa  277  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  52 
 
 		 313 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1200  porphobilinogen deaminase  50.99 
 
 		 321 aa  275  7e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.580193  normal  0.533215 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  51.67 
 
 		 313 aa  275  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  50.82 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  49.16 
 
 		 312 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  49.01 
 
 		 314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0656  porphobilinogen deaminase  50.49 
 
 		 325 aa  269  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1437  porphobilinogen deaminase  51.52 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3674  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2749  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0700  porphobilinogen deaminase  50.82 
 
 		 334 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2357  porphobilinogen deaminase  52.3 
 
 		 334 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206721  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2571  porphobilinogen deaminase  52.12 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  47.52 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2690  porphobilinogen deaminase  49.66 
 
 		 321 aa  258  8e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0035  porphobilinogen deaminase  49.33 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  48.66 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2166  porphobilinogen deaminase  51.14 
 
 		 338 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.600756 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0061  porphobilinogen deaminase  48.16 
 
 		 311 aa  255  8e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0098  porphobilinogen deaminase  45.9 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1069  porphobilinogen deaminase  50.66 
 
 		 342 aa  252  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5752  porphobilinogen deaminase  51.16 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0869  porphobilinogen deaminase  50.83 
 
 		 402 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326995  normal  0.554351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2890  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0089  hydroxymethylbilane synthase  45.18 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1813  porphobilinogen deaminase  51.49 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.57316  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2429  porphobilinogen deaminase  51.49 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.237637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2377  porphobilinogen deaminase  50.17 
 
 		 310 aa  249  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  47.84 
 
 		 300 aa  250  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>