More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3530 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3530  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 303 aa  598  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04137  porphobilinogen deaminase  79.4 
 
 		 304 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.870517  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1225  porphobilinogen deaminase  70.43 
 
 		 305 aa  412  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1258  porphobilinogen deaminase  70.1 
 
 		 305 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  57.14 
 
 		 310 aa  331  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  59.53 
 
 		 351 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  60.34 
 
 		 315 aa  326  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  57.28 
 
 		 316 aa  326  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  56 
 
 		 308 aa  323  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  58.53 
 
 		 322 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  55.15 
 
 		 317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  59.87 
 
 		 313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  54.85 
 
 		 310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  54.85 
 
 		 310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  55.85 
 
 		 310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  54.85 
 
 		 310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  54.85 
 
 		 309 aa  318  7e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  54.52 
 
 		 310 aa  317  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  54.85 
 
 		 310 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  55.81 
 
 		 309 aa  315  8e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  55.18 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  57.86 
 
 		 313 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  54.52 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  54.52 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  54.67 
 
 		 317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  53.85 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  55.18 
 
 		 309 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  54.52 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  56.15 
 
 		 313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  55.18 
 
 		 309 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  57.86 
 
 		 312 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  58.86 
 
 		 314 aa  311  6.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  56.19 
 
 		 313 aa  311  9e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  54.85 
 
 		 326 aa  311  9e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  56.11 
 
 		 311 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  55.18 
 
 		 311 aa  309  4e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  55.52 
 
 		 313 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  57.19 
 
 		 313 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  56.52 
 
 		 313 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  54 
 
 		 309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  55.33 
 
 		 312 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  55.52 
 
 		 313 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  57.38 
 
 		 313 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  54.52 
 
 		 317 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  56.52 
 
 		 313 aa  305  7e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  55.52 
 
 		 313 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  55.18 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  54.18 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  54.85 
 
 		 318 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  54.85 
 
 		 320 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  54.85 
 
 		 320 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  53.69 
 
 		 310 aa  301  6.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  54.85 
 
 		 320 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  54.85 
 
 		 318 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  54.52 
 
 		 313 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  53.51 
 
 		 312 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  54.52 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  54.52 
 
 		 313 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  51.33 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  54.85 
 
 		 313 aa  297  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  54.33 
 
 		 313 aa  297  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  54.33 
 
 		 313 aa  297  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  54 
 
 		 313 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  52.98 
 
 		 319 aa  295  5e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  52.98 
 
 		 306 aa  295  7e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  56.52 
 
 		 313 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  52.32 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  56.19 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  53.82 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  53.82 
 
 		 320 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  53.82 
 
 		 320 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  53.82 
 
 		 313 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  53.82 
 
 		 313 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  50.8 
 
 		 321 aa  288  1e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  53.33 
 
 		 313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1437  porphobilinogen deaminase  52.67 
 
 		 310 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0764  porphobilinogen deaminase  53.82 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000120999 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  50.17 
 
 		 314 aa  276  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0061  porphobilinogen deaminase  48.32 
 
 		 311 aa  275  6e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2890  porphobilinogen deaminase  55.48 
 
 		 320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0089  hydroxymethylbilane synthase  47.43 
 
 		 345 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2749  porphobilinogen deaminase  51.84 
 
 		 334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0872  porphobilinogen deaminase  57.72 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2377  porphobilinogen deaminase  55.15 
 
 		 310 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2690  porphobilinogen deaminase  53.02 
 
 		 321 aa  272  6e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0098  porphobilinogen deaminase  47.89 
 
 		 345 aa  271  7e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3674  porphobilinogen deaminase  51.34 
 
 		 311 aa  271  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  49.06 
 
 		 339 aa  271  9e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1597  porphobilinogen deaminase  58.87 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0730  porphobilinogen deaminase  58.87 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1229  porphobilinogen deaminase  58.87 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3000  porphobilinogen deaminase  58.87 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1077  porphobilinogen deaminase  58.87 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.941716  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2284  porphobilinogen deaminase  58.87 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  49.17 
 
 		 326 aa  269  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1071  porphobilinogen deaminase  58.87 
 
 		 329 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1069  porphobilinogen deaminase  53.31 
 
 		 342 aa  268  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2166  porphobilinogen deaminase  52.65 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.600756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0700  porphobilinogen deaminase  51.17 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0035  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 310 aa  265  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>