More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1322 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1322  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 314 aa  627  1e-179  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0767  porphobilinogen deaminase  63.75 
 
 		 311 aa  393  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  62.21 
 
 		 313 aa  387  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1048  porphobilinogen deaminase  60.52 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0191591  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  59.87 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0767  porphobilinogen deaminase  56.54 
 
 		 308 aa  359  3e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0649  porphobilinogen deaminase  58.17 
 
 		 307 aa  352  5.9999999999999994e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.485602  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0570  porphobilinogen deaminase  58.17 
 
 		 307 aa  352  5.9999999999999994e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1385  porphobilinogen deaminase  58.82 
 
 		 307 aa  351  7e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0691  porphobilinogen deaminase  57.76 
 
 		 303 aa  335  7e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.411778  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  57.38 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  54 
 
 		 322 aa  318  9e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  55.7 
 
 		 309 aa  316  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  56.29 
 
 		 317 aa  315  9e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  55.37 
 
 		 326 aa  311  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  54.36 
 
 		 309 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  53.97 
 
 		 309 aa  308  6.999999999999999e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  54.33 
 
 		 317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  53.09 
 
 		 310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  54 
 
 		 312 aa  305  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  53.82 
 
 		 313 aa  306  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  54 
 
 		 312 aa  305  8.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  54.36 
 
 		 309 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  53.97 
 
 		 310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  52.16 
 
 		 320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  53.97 
 
 		 310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  53.97 
 
 		 310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  53.97 
 
 		 310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  51.83 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  51.83 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  51.83 
 
 		 318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  51.83 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  51.83 
 
 		 318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  51.83 
 
 		 313 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  51.83 
 
 		 313 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  51.83 
 
 		 320 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  53.69 
 
 		 315 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  52.68 
 
 		 313 aa  300  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  52.98 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  52.98 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  52.98 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  52.98 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  52.65 
 
 		 310 aa  299  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  53.27 
 
 		 313 aa  299  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  52 
 
 		 318 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  52 
 
 		 313 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  52 
 
 		 320 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  52 
 
 		 313 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  52 
 
 		 320 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  53.33 
 
 		 317 aa  297  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  52.13 
 
 		 313 aa  297  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  52.13 
 
 		 313 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  50.99 
 
 		 311 aa  297  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  52.01 
 
 		 313 aa  296  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  50.48 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  52.13 
 
 		 313 aa  295  5e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  51.68 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  51.16 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  51 
 
 		 313 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  50.99 
 
 		 312 aa  292  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  52.79 
 
 		 316 aa  292  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  50.99 
 
 		 313 aa  291  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  51.82 
 
 		 308 aa  291  8e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  51.67 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  52.63 
 
 		 313 aa  290  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  49.66 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  50.66 
 
 		 313 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  51.17 
 
 		 314 aa  287  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  49.83 
 
 		 314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 313 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 318 aa  285  9e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  48.68 
 
 		 313 aa  285  9e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  49.68 
 
 		 317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  51.47 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  51.88 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  49.34 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 310 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  48.86 
 
 		 316 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 310 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  48.34 
 
 		 313 aa  278  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  48.18 
 
 		 306 aa  278  8e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 318 aa  277  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  49.34 
 
 		 351 aa  277  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  47.9 
 
 		 310 aa  276  5e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 		 313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 		 313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  50.32 
 
 		 316 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 316 aa  269  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  49 
 
 		 319 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  49.05 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1437  porphobilinogen deaminase  48.51 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  47.83 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  47.68 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>