More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0318 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0318  porphobilinogen deaminase  100 
 
 
299 aa  600  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0707  porphobilinogen deaminase  51.79 
 
 
279 aa  249  5e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  42.42 
 
 
318 aa  236  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  44.41 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  43.23 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  43.23 
 
 
309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  43.23 
 
 
309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  42.71 
 
 
318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  42.9 
 
 
309 aa  232  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  42.9 
 
 
309 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  42.9 
 
 
309 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  42.9 
 
 
309 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  42.9 
 
 
309 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  42.9 
 
 
309 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  44.84 
 
 
309 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  41.5 
 
 
318 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  45.85 
 
 
311 aa  230  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  46.99 
 
 
306 aa  229  6e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  46.59 
 
 
315 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  41.84 
 
 
318 aa  227  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  49.6 
 
 
310 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  41.84 
 
 
318 aa  226  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  45.75 
 
 
310 aa  225  7e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3664  porphobilinogen deaminase  42.48 
 
 
334 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  40.41 
 
 
310 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  42.97 
 
 
303 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  47.29 
 
 
311 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6800  porphobilinogen deaminase  39.34 
 
 
320 aa  222  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  46.37 
 
 
312 aa  222  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2377  porphobilinogen deaminase  41.83 
 
 
310 aa  222  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2890  porphobilinogen deaminase  41.44 
 
 
320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  42.97 
 
 
303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  43.37 
 
 
309 aa  220  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1999  porphobilinogen deaminase  44.35 
 
 
318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  decreased coverage  0.0000671123 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1422  porphobilinogen deaminase  41.44 
 
 
291 aa  218  7e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.168494  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2839  porphobilinogen deaminase  37.85 
 
 
307 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1838  porphobilinogen deaminase  46.59 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1688  porphobilinogen deaminase  41.1 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.814141  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  42.8 
 
 
311 aa  216  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0764  porphobilinogen deaminase  43.2 
 
 
322 aa  215  5.9999999999999996e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000120999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  42.47 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  43.87 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2232  porphobilinogen deaminase  40.07 
 
 
312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495959  normal  0.0113482 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  37.88 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  44.4 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  44.58 
 
 
304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  43.78 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2527  porphobilinogen deaminase  43.87 
 
 
292 aa  211  9e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.464027  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  43.7 
 
 
313 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  36.61 
 
 
310 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3090  porphobilinogen deaminase  42.86 
 
 
331 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  41.41 
 
 
309 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  43.6 
 
 
321 aa  211  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  38.91 
 
 
315 aa  210  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  41.01 
 
 
308 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1715  porphobilinogen deaminase  41.94 
 
 
315 aa  209  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  44.62 
 
 
308 aa  210  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  41.02 
 
 
309 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  37.76 
 
 
300 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5394  porphobilinogen deaminase  42.06 
 
 
309 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1374  porphobilinogen deaminase  42.06 
 
 
308 aa  208  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212718  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  42.13 
 
 
305 aa  208  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  42.4 
 
 
309 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  35.62 
 
 
310 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0975  porphobilinogen deaminase  43.6 
 
 
314 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1200  porphobilinogen deaminase  39.08 
 
 
321 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.580193  normal  0.533215 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  38.01 
 
 
311 aa  206  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  37.75 
 
 
309 aa  206  5e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  37.84 
 
 
313 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  43.36 
 
 
309 aa  206  5e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  38.57 
 
 
315 aa  205  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  38.51 
 
 
313 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  38.18 
 
 
313 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  38.18 
 
 
313 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  37.16 
 
 
313 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  37.16 
 
 
320 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  37.16 
 
 
320 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  37.16 
 
 
320 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  37.16 
 
 
318 aa  203  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  41.04 
 
 
306 aa  203  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3530  porphobilinogen deaminase  39.07 
 
 
303 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  37.16 
 
 
318 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  36.7 
 
 
310 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  37.29 
 
 
308 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  37.16 
 
 
313 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1198  porphobilinogen deaminase  41.79 
 
 
290 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  38.18 
 
 
313 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  41.27 
 
 
310 aa  203  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  37.16 
 
 
320 aa  203  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  37.29 
 
 
351 aa  203  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3202  porphobilinogen deaminase  45.85 
 
 
309 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  37.16 
 
 
320 aa  203  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3002  hydroxymethylbilane synthase  40.87 
 
 
317 aa  202  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00423817  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1732  porphobilinogen deaminase  39.1 
 
 
318 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0335479  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  40.94 
 
 
309 aa  202  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  36.36 
 
 
317 aa  202  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  38.18 
 
 
313 aa  202  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  41.5 
 
 
313 aa  202  5e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  38.18 
 
 
320 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  38.18 
 
 
318 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>