More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1198 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1198  porphobilinogen deaminase  100 
 
 
290 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1422  porphobilinogen deaminase  40.28 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.168494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1688  porphobilinogen deaminase  39.93 
 
 
291 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.814141  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  41.83 
 
 
310 aa  207  1e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0318  porphobilinogen deaminase  41.79 
 
 
299 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  40 
 
 
308 aa  199  5e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0262  porphobilinogen deaminase  37.5 
 
 
303 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.207863  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0767  porphobilinogen deaminase  36.55 
 
 
311 aa  191  9e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  38.49 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  38.49 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  39.38 
 
 
318 aa  188  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  39.92 
 
 
358 aa  187  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  37.24 
 
 
315 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  38.49 
 
 
314 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  38.14 
 
 
311 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04137  porphobilinogen deaminase  35.27 
 
 
304 aa  186  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.870517  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  38.18 
 
 
309 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  39.18 
 
 
313 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0495  porphobilinogen deaminase  35.93 
 
 
314 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  39.38 
 
 
318 aa  185  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  38.68 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  38.83 
 
 
312 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  39.18 
 
 
318 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  38.44 
 
 
318 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  40.62 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  37.05 
 
 
313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  37.32 
 
 
308 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1163  porphobilinogen deaminase  37.72 
 
 
293 aa  181  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  39.18 
 
 
311 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  40.7 
 
 
313 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1048  porphobilinogen deaminase  36.43 
 
 
309 aa  181  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0191591  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  36.36 
 
 
312 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0549  Hydroxymethylbilane synthase  37.19 
 
 
306 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  0.484278 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  36.86 
 
 
310 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  35.29 
 
 
322 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3530  porphobilinogen deaminase  33.9 
 
 
303 aa  179  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  34.6 
 
 
313 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  39.38 
 
 
309 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  36.96 
 
 
309 aa  179  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0649  porphobilinogen deaminase  36.93 
 
 
307 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.485602  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0570  porphobilinogen deaminase  36.93 
 
 
307 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  37.76 
 
 
318 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1385  porphobilinogen deaminase  38.61 
 
 
307 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0217  porphobilinogen deaminase  39.39 
 
 
290 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000356603  normal  0.0285906 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  34.02 
 
 
309 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1838  porphobilinogen deaminase  38.95 
 
 
305 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  40.14 
 
 
309 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  34.47 
 
 
313 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  34.47 
 
 
313 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  36.08 
 
 
313 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0707  porphobilinogen deaminase  40.49 
 
 
279 aa  176  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  34.47 
 
 
313 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3090  porphobilinogen deaminase  38 
 
 
331 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  39.37 
 
 
309 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  40.14 
 
 
309 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  40.29 
 
 
285 aa  176  4e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  38.33 
 
 
309 aa  175  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  40.14 
 
 
309 aa  175  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  39.78 
 
 
309 aa  175  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  39.78 
 
 
309 aa  175  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  39.78 
 
 
309 aa  175  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  38.98 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4579  porphobilinogen deaminase  35.25 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  39.04 
 
 
313 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0764  porphobilinogen deaminase  39.06 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000120999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  35.93 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0491  porphobilinogen deaminase  37.11 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  39.43 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  36.08 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  36.33 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1370  porphobilinogen deaminase  37.41 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  36.08 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  36.08 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  36.08 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  38.27 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  36.08 
 
 
313 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  36.08 
 
 
313 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  32.99 
 
 
317 aa  172  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  33.22 
 
 
315 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  35.74 
 
 
320 aa  172  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02860  porphobilinogen deaminase  37.01 
 
 
316 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.302767  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  35.74 
 
 
318 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  35.99 
 
 
312 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  34.02 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  33.33 
 
 
310 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  34.71 
 
 
317 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  37.65 
 
 
321 aa  171  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  33.22 
 
 
315 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  35.4 
 
 
320 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0767  porphobilinogen deaminase  35.36 
 
 
308 aa  170  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  35.94 
 
 
313 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1454  porphobilinogen deaminase  37.88 
 
 
288 aa  170  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.179158  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  34.71 
 
 
309 aa  170  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  36.05 
 
 
300 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  33.68 
 
 
326 aa  169  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  36.43 
 
 
313 aa  169  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  35.05 
 
 
320 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  35.05 
 
 
318 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2984  porphobilinogen deaminase  35.27 
 
 
304 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.896426 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  35.05 
 
 
320 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>