More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1544 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 305 aa  579  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4439  porphobilinogen deaminase  55.88 
 
 		 311 aa  298  8e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4579  porphobilinogen deaminase  58.09 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26790  hydroxymethylbilane synthase  54.22 
 
 		 337 aa  288  9e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0549  Hydroxymethylbilane synthase  53.47 
 
 		 306 aa  279  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  0.484278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2732  porphobilinogen deaminase  56.21 
 
 		 320 aa  278  8e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0677  porphobilinogen deaminase  55.7 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0690  porphobilinogen deaminase  55.7 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0670  porphobilinogen deaminase  55.37 
 
 		 314 aa  275  5e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4371  porphobilinogen deaminase  52.81 
 
 		 335 aa  275  9e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6729  porphobilinogen deaminase  55.12 
 
 		 313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8325  porphobilinogen deaminase  53.8 
 
 		 317 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3252  porphobilinogen deaminase  57.93 
 
 		 343 aa  271  9e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0180697  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0495  porphobilinogen deaminase  54 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0357  porphobilinogen deaminase  53.92 
 
 		 322 aa  268  8e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36050  hydroxymethylbilane synthase  54.4 
 
 		 312 aa  267  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000727024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4012  porphobilinogen deaminase  59.22 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  normal  0.94998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10521  porphobilinogen deaminase  53.42 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0845  porphobilinogen deaminase  52.92 
 
 		 312 aa  262  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.026448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0427  porphobilinogen deaminase  53.95 
 
 		 322 aa  262  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.751162  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2492  porphobilinogen deaminase  59.62 
 
 		 344 aa  261  8e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0471431  normal  0.22632 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0668  porphobilinogen deaminase  50.98 
 
 		 318 aa  258  6e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0262  porphobilinogen deaminase  51.34 
 
 		 303 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.207863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0066  porphobilinogen deaminase  52.09 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0447079  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  57.36 
 
 		 358 aa  255  5e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2767  porphobilinogen deaminase  53.72 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2489  porphobilinogen deaminase  51.24 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3437  porphobilinogen deaminase  56.88 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000351099  decreased coverage  0.00118997 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1014  porphobilinogen deaminase  51.63 
 
 		 313 aa  250  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0827893  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02860  porphobilinogen deaminase  49.68 
 
 		 316 aa  248  7e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.302767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  52.79 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15190  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.229707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  44.74 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  45.39 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  46.89 
 
 		 313 aa  235  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6130  porphobilinogen deaminase  46.75 
 
 		 354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0486  porphobilinogen deaminase  45.53 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.471298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  44.41 
 
 		 318 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1732  porphobilinogen deaminase  45.36 
 
 		 318 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0335479  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  47.47 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  45.75 
 
 		 315 aa  226  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  43.93 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  42.11 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  41.83 
 
 		 309 aa  225  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  46.38 
 
 		 312 aa  225  8e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  43.61 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6800  porphobilinogen deaminase  44.3 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  43.46 
 
 		 326 aa  223  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  43.14 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  46.41 
 
 		 309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  41.83 
 
 		 310 aa  222  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  43.79 
 
 		 313 aa  222  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  40.46 
 
 		 310 aa  222  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  43.79 
 
 		 313 aa  222  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  43.62 
 
 		 311 aa  221  9e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  43.79 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  46.82 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  38.67 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  42.95 
 
 		 312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  46.31 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  43.42 
 
 		 351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  44.59 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3202  porphobilinogen deaminase  47.02 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0969809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  47 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0406  porphobilinogen deaminase  44.7 
 
 		 311 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  45.97 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1838  porphobilinogen deaminase  47.51 
 
 		 305 aa  219  6e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  42.81 
 
 		 313 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  41.5 
 
 		 317 aa  218  7e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  39.46 
 
 		 309 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  45.07 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  44.77 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  43.42 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  45.9 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  42.16 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  37.95 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  45.07 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  45.25 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  45.25 
 
 		 313 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  45.25 
 
 		 318 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  45.25 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  45.25 
 
 		 313 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  45.07 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  45.42 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  41.18 
 
 		 309 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  45.1 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  41.25 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  42.48 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  41.18 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  41.5 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  42.33 
 
 		 310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5394  porphobilinogen deaminase  47.16 
 
 		 309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  41.5 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  41.5 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  44.67 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  41.5 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  43.75 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  43.71 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  41.5 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  41.31 
 
 		 310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>