More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2732 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2732  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 320 aa  622  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4371  porphobilinogen deaminase  74.84 
 
 		 335 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4439  porphobilinogen deaminase  63.69 
 
 		 311 aa  345  7e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0262  porphobilinogen deaminase  61.69 
 
 		 303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.207863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0549  Hydroxymethylbilane synthase  60.19 
 
 		 306 aa  331  8e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  0.484278 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4579  porphobilinogen deaminase  56.82 
 
 		 312 aa  291  8e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  58.7 
 
 		 305 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8325  porphobilinogen deaminase  54.28 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0495  porphobilinogen deaminase  54.29 
 
 		 314 aa  278  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  62.45 
 
 		 358 aa  276  4e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02860  porphobilinogen deaminase  52.53 
 
 		 316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.302767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0357  porphobilinogen deaminase  54.02 
 
 		 322 aa  271  8.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0427  porphobilinogen deaminase  53.35 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.751162  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0668  porphobilinogen deaminase  52.37 
 
 		 318 aa  263  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26790  hydroxymethylbilane synthase  50.75 
 
 		 337 aa  262  6e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6130  porphobilinogen deaminase  48.27 
 
 		 354 aa  262  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1014  porphobilinogen deaminase  51.27 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0827893  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0677  porphobilinogen deaminase  50.47 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0690  porphobilinogen deaminase  50.47 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6729  porphobilinogen deaminase  51.63 
 
 		 313 aa  259  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0670  porphobilinogen deaminase  50.16 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2767  porphobilinogen deaminase  55.59 
 
 		 332 aa  259  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3252  porphobilinogen deaminase  54.69 
 
 		 343 aa  251  9.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0180697  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15190  porphobilinogen deaminase  47.75 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.229707  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2489  porphobilinogen deaminase  51.66 
 
 		 332 aa  250  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3437  porphobilinogen deaminase  55.64 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000351099  decreased coverage  0.00118997 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36050  hydroxymethylbilane synthase  51.26 
 
 		 312 aa  245  6e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000727024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10521  porphobilinogen deaminase  49.68 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  51.62 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0618  porphobilinogen deaminase  56.95 
 
 		 326 aa  239  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0490105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0845  porphobilinogen deaminase  49.2 
 
 		 312 aa  238  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.026448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0486  porphobilinogen deaminase  45.58 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.471298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4012  porphobilinogen deaminase  56.3 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  normal  0.94998 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2492  porphobilinogen deaminase  52.69 
 
 		 344 aa  232  7.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0471431  normal  0.22632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0066  porphobilinogen deaminase  47.44 
 
 		 312 aa  230  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0447079  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  46.08 
 
 		 314 aa  225  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  43.95 
 
 		 318 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  40.19 
 
 		 309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  46.08 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  46.08 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  41.4 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  39.62 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  42.68 
 
 		 318 aa  219  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  46.08 
 
 		 313 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  44.41 
 
 		 309 aa  215  8e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  41.46 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  38.69 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  41.14 
 
 		 318 aa  212  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  38.76 
 
 		 313 aa  209  6e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  41.88 
 
 		 315 aa  209  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  39.22 
 
 		 313 aa  209  7e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  40.71 
 
 		 310 aa  208  9e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  36.45 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  41.4 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  41.21 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  42.95 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  43.51 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  41.53 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  40.95 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0710  porphobilinogen deaminase  43.18 
 
 		 307 aa  205  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1838  porphobilinogen deaminase  43.59 
 
 		 305 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  43.31 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  37.82 
 
 		 313 aa  203  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  39.74 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  40.82 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  39.29 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  41.21 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  38.24 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  40.19 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  41.5 
 
 		 351 aa  203  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  40.76 
 
 		 309 aa  203  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  41.53 
 
 		 317 aa  203  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  40.06 
 
 		 309 aa  203  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  40.38 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  41.88 
 
 		 313 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  40.65 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 320 aa  202  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3202  porphobilinogen deaminase  42.04 
 
 		 318 aa  202  6e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0969809  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  42.45 
 
 		 312 aa  202  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  41.03 
 
 		 310 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  41.03 
 
 		 310 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  41.03 
 
 		 310 aa  202  7e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  41.03 
 
 		 310 aa  202  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3002  hydroxymethylbilane synthase  43.26 
 
 		 317 aa  202  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00423817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 310 aa  201  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 318 aa  202  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  42.81 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  40.71 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0767  porphobilinogen deaminase  37.94 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  41.03 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  40.82 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  40.06 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  41.25 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  41.03 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  41.03 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  40.13 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  41.03 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  40.33 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  41.04 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  41.03 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>