More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0495 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0495  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 314 aa  592  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4579  porphobilinogen deaminase  63.91 
 
 		 312 aa  341  9e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6729  porphobilinogen deaminase  58.36 
 
 		 313 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0845  porphobilinogen deaminase  57.61 
 
 		 312 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.026448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0357  porphobilinogen deaminase  56.17 
 
 		 322 aa  301  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0427  porphobilinogen deaminase  56.17 
 
 		 322 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.751162  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0668  porphobilinogen deaminase  57.47 
 
 		 318 aa  298  8e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0677  porphobilinogen deaminase  56.49 
 
 		 314 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0690  porphobilinogen deaminase  56.49 
 
 		 314 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0066  porphobilinogen deaminase  55.99 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0447079  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02860  porphobilinogen deaminase  61.19 
 
 		 316 aa  294  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.302767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10521  porphobilinogen deaminase  57.65 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0670  porphobilinogen deaminase  56.17 
 
 		 314 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4439  porphobilinogen deaminase  57.57 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1014  porphobilinogen deaminase  54.66 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0827893  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4371  porphobilinogen deaminase  55.59 
 
 		 335 aa  287  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0549  Hydroxymethylbilane synthase  53.92 
 
 		 306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  0.484278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0262  porphobilinogen deaminase  55.23 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.207863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6130  porphobilinogen deaminase  53.13 
 
 		 354 aa  275  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2732  porphobilinogen deaminase  54.29 
 
 		 320 aa  265  5e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8325  porphobilinogen deaminase  52.65 
 
 		 317 aa  262  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  55.52 
 
 		 305 aa  261  6.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  63.01 
 
 		 358 aa  260  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  51.96 
 
 		 331 aa  259  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0486  porphobilinogen deaminase  49.13 
 
 		 395 aa  257  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.471298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3252  porphobilinogen deaminase  54.57 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0180697  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26790  hydroxymethylbilane synthase  52.6 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2489  porphobilinogen deaminase  51.65 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36050  hydroxymethylbilane synthase  49.68 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000727024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0618  porphobilinogen deaminase  58.8 
 
 		 326 aa  243  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0490105 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3437  porphobilinogen deaminase  54.58 
 
 		 342 aa  238  8e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000351099  decreased coverage  0.00118997 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2767  porphobilinogen deaminase  52.67 
 
 		 332 aa  232  7.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  45.39 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15190  porphobilinogen deaminase  45.96 
 
 		 377 aa  226  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.229707  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  44.69 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  43.75 
 
 		 311 aa  221  9e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  42.77 
 
 		 318 aa  221  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4012  porphobilinogen deaminase  56.46 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  normal  0.94998 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  44.23 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  45.93 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  43.32 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  39.1 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  45.21 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  42.9 
 
 		 312 aa  215  7e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  38.64 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  42.48 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  42.81 
 
 		 311 aa  212  7e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  41.48 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  41.48 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  42.24 
 
 		 312 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  42.95 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  43.56 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2492  porphobilinogen deaminase  49.81 
 
 		 344 aa  206  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0471431  normal  0.22632 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  43 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  43 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  43 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  43 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  43 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  43 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  43 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  43 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  43.89 
 
 		 314 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  43.89 
 
 		 314 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  42.3 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  42.3 
 
 		 309 aa  205  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1838  porphobilinogen deaminase  45.42 
 
 		 305 aa  205  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  45.48 
 
 		 312 aa  205  9e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  43.33 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  41.97 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  43.33 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  43.33 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  43.33 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  42.67 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  43.33 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  40.13 
 
 		 310 aa  203  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  43.48 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  42 
 
 		 316 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  42.44 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  40.59 
 
 		 310 aa  203  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  43 
 
 		 313 aa  202  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  44.13 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  40.32 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  42.67 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  41.31 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  37.62 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  40.33 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3202  porphobilinogen deaminase  44.2 
 
 		 318 aa  199  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0969809  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  44.26 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  39.24 
 
 		 336 aa  198  7.999999999999999e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  42.52 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  42.57 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  40.98 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  40.98 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  41.31 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  40.98 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  41.31 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  37.01 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  40.26 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  40.92 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>