More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_15190 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_15190  porphobilinogen deaminase  100 
 
 
377 aa  713    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.229707  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3252  porphobilinogen deaminase  54.19 
 
 
343 aa  280  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0180697  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3437  porphobilinogen deaminase  58.15 
 
 
342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000351099  decreased coverage  0.00118997 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  50.41 
 
 
358 aa  268  8e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2767  porphobilinogen deaminase  55.45 
 
 
332 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4371  porphobilinogen deaminase  48.59 
 
 
335 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36050  hydroxymethylbilane synthase  49.86 
 
 
312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000727024  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4579  porphobilinogen deaminase  54.03 
 
 
312 aa  252  9.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2489  porphobilinogen deaminase  50.28 
 
 
332 aa  252  9.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4439  porphobilinogen deaminase  47.22 
 
 
311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2732  porphobilinogen deaminase  48.02 
 
 
320 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2492  porphobilinogen deaminase  52.31 
 
 
344 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0471431  normal  0.22632 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  50 
 
 
305 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26790  hydroxymethylbilane synthase  48.65 
 
 
337 aa  238  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0549  Hydroxymethylbilane synthase  46.11 
 
 
306 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  0.484278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8325  porphobilinogen deaminase  45.87 
 
 
317 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0262  porphobilinogen deaminase  47.4 
 
 
303 aa  230  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.207863  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4012  porphobilinogen deaminase  55.87 
 
 
334 aa  226  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  normal  0.94998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0495  porphobilinogen deaminase  45.96 
 
 
314 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0357  porphobilinogen deaminase  48.74 
 
 
322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0677  porphobilinogen deaminase  49.19 
 
 
314 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0690  porphobilinogen deaminase  49.19 
 
 
314 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10521  porphobilinogen deaminase  50.49 
 
 
309 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0670  porphobilinogen deaminase  48.87 
 
 
314 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6130  porphobilinogen deaminase  45.07 
 
 
354 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0066  porphobilinogen deaminase  48.53 
 
 
312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0447079  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0427  porphobilinogen deaminase  47.71 
 
 
322 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.751162  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6729  porphobilinogen deaminase  47.88 
 
 
313 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0845  porphobilinogen deaminase  44.72 
 
 
312 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.026448  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  42.9 
 
 
311 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1014  porphobilinogen deaminase  47.08 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0827893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  44.08 
 
 
309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02860  porphobilinogen deaminase  48.91 
 
 
316 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.302767  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  38.74 
 
 
311 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0668  porphobilinogen deaminase  48.74 
 
 
318 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  43.07 
 
 
309 aa  206  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0486  porphobilinogen deaminase  43.78 
 
 
395 aa  202  9e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.471298  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  43.33 
 
 
303 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  41.01 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  40.84 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  40.84 
 
 
309 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  40.84 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  41.71 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  40.84 
 
 
309 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  40.84 
 
 
309 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  46.75 
 
 
331 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  40.64 
 
 
314 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  40.64 
 
 
314 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  40.88 
 
 
309 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  40.84 
 
 
309 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  40.51 
 
 
309 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  43.17 
 
 
303 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  39.55 
 
 
318 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  40.84 
 
 
309 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  38.55 
 
 
318 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  40.38 
 
 
311 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  38.94 
 
 
306 aa  193  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  40.57 
 
 
309 aa  193  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  42.81 
 
 
313 aa  192  9e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  40.96 
 
 
324 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  36.19 
 
 
309 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  39.89 
 
 
315 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2070  porphobilinogen deaminase  40.38 
 
 
327 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0208859  hitchhiker  0.0000965484 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1422  porphobilinogen deaminase  37.72 
 
 
291 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.168494  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  43.41 
 
 
313 aa  189  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0618  porphobilinogen deaminase  53.82 
 
 
326 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0490105 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  37.85 
 
 
321 aa  189  7e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  39.23 
 
 
309 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1688  porphobilinogen deaminase  37.72 
 
 
291 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.814141  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  38.98 
 
 
311 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  40.91 
 
 
313 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0318  porphobilinogen deaminase  39.35 
 
 
299 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  40.19 
 
 
308 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  37.18 
 
 
318 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  39.8 
 
 
314 aa  187  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  39.5 
 
 
308 aa  187  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  39.71 
 
 
315 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  34.23 
 
 
310 aa  186  6e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  37.46 
 
 
318 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  41.88 
 
 
317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04137  porphobilinogen deaminase  43.93 
 
 
304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.870517  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  32.23 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  42.17 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0691  porphobilinogen deaminase  36.86 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.411778  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  35.11 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2966  porphobilinogen deaminase  38.96 
 
 
330 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  37.36 
 
 
310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  42.07 
 
 
309 aa  182  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  39.09 
 
 
313 aa  182  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  36.72 
 
 
309 aa  182  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  36.61 
 
 
317 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  37.18 
 
 
318 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  36.06 
 
 
309 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  38.98 
 
 
310 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  40.52 
 
 
312 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  33.24 
 
 
313 aa  180  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1048  porphobilinogen deaminase  35.98 
 
 
309 aa  180  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0191591  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  40.13 
 
 
320 aa  180  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  36.44 
 
 
310 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  41.12 
 
 
310 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>