More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0618 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0618  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 326 aa  609  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0490105 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  65.98 
 
 		 358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0262  porphobilinogen deaminase  57.63 
 
 		 303 aa  280  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.207863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4371  porphobilinogen deaminase  62.45 
 
 		 335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0549  Hydroxymethylbilane synthase  56.27 
 
 		 306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  0.484278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0495  porphobilinogen deaminase  58.8 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4439  porphobilinogen deaminase  64.2 
 
 		 311 aa  271  9e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2732  porphobilinogen deaminase  56.95 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8325  porphobilinogen deaminase  60.82 
 
 		 317 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02860  porphobilinogen deaminase  51.94 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.302767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4579  porphobilinogen deaminase  61.73 
 
 		 312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6130  porphobilinogen deaminase  53.89 
 
 		 354 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0357  porphobilinogen deaminase  54.25 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6729  porphobilinogen deaminase  51.8 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36050  hydroxymethylbilane synthase  57.46 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000727024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0427  porphobilinogen deaminase  54.25 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.751162  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2489  porphobilinogen deaminase  58.27 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100869 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1014  porphobilinogen deaminase  51.83 
 
 		 313 aa  242  7e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0827893  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  51.09 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2767  porphobilinogen deaminase  55.08 
 
 		 332 aa  238  6.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3437  porphobilinogen deaminase  58.33 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000351099  decreased coverage  0.00118997 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3252  porphobilinogen deaminase  57.38 
 
 		 343 aa  237  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0180697  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26790  hydroxymethylbilane synthase  59.6 
 
 		 337 aa  236  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  57.89 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10521  porphobilinogen deaminase  50.83 
 
 		 309 aa  236  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4012  porphobilinogen deaminase  61.87 
 
 		 334 aa  235  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  normal  0.94998 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2492  porphobilinogen deaminase  55.91 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0471431  normal  0.22632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0677  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0690  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0670  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0668  porphobilinogen deaminase  56.79 
 
 		 318 aa  228  8e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  51.19 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  51.19 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  50.51 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15190  porphobilinogen deaminase  54.21 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.229707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  49.19 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  43.87 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  47.99 
 
 		 309 aa  220  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1838  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  46.75 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  41.69 
 
 		 311 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0486  porphobilinogen deaminase  48.34 
 
 		 395 aa  219  7e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.471298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  48.77 
 
 		 318 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  49.66 
 
 		 313 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  40.88 
 
 		 311 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  44.08 
 
 		 310 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  49 
 
 		 303 aa  212  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0845  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 312 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.026448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0066  porphobilinogen deaminase  49.34 
 
 		 312 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0447079  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  44.93 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  47.83 
 
 		 303 aa  209  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  41.75 
 
 		 318 aa  208  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  42.65 
 
 		 309 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0701  porphobilinogen deaminase  36.91 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.141584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  44.98 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  42.03 
 
 		 318 aa  207  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  44.58 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  41.28 
 
 		 309 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  47.97 
 
 		 310 aa  207  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  42.76 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  44.58 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  44.58 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  44.58 
 
 		 309 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  44.58 
 
 		 309 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  44.03 
 
 		 315 aa  205  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  44.58 
 
 		 309 aa  205  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  44.58 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  44.58 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  44.18 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  48.78 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  47.39 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0354  porphobilinogen deaminase  41.63 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  38.67 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1715  porphobilinogen deaminase  48.63 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  40.68 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  43.98 
 
 		 311 aa  203  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  40.91 
 
 		 308 aa  202  7e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  46.78 
 
 		 300 aa  202  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  40.72 
 
 		 321 aa  202  8e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  44.14 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  41.28 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  42.86 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0318  porphobilinogen deaminase  42.23 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  41.98 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  43.77 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  42.32 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  42.33 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  43.48 
 
 		 320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  47.76 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  43.48 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  43.48 
 
 		 320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  43.48 
 
 		 313 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  43.48 
 
 		 313 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  43.83 
 
 		 322 aa  199  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  42.66 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  41.98 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  41.28 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  46.64 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  38.67 
 
 		 313 aa  197  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  46.12 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>