More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6130 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6130  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 354 aa  669    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0486  porphobilinogen deaminase  74.57 
 
 		 395 aa  433  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.471298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4579  porphobilinogen deaminase  53.43 
 
 		 312 aa  278  8e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6729  porphobilinogen deaminase  52.71 
 
 		 313 aa  276  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0357  porphobilinogen deaminase  53.39 
 
 		 322 aa  275  7e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0495  porphobilinogen deaminase  53.13 
 
 		 314 aa  275  7e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0427  porphobilinogen deaminase  52.82 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.751162  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4439  porphobilinogen deaminase  50.45 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02860  porphobilinogen deaminase  48.81 
 
 		 316 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.302767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8325  porphobilinogen deaminase  49.55 
 
 		 317 aa  255  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2732  porphobilinogen deaminase  47.98 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4371  porphobilinogen deaminase  46.31 
 
 		 335 aa  249  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0549  Hydroxymethylbilane synthase  48.5 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  0.484278 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1014  porphobilinogen deaminase  48.06 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0827893  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0668  porphobilinogen deaminase  49.55 
 
 		 318 aa  246  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0262  porphobilinogen deaminase  49.4 
 
 		 303 aa  245  8e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.207863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  49.55 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0677  porphobilinogen deaminase  46.25 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0690  porphobilinogen deaminase  46.25 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10521  porphobilinogen deaminase  46.99 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0670  porphobilinogen deaminase  46.13 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36050  hydroxymethylbilane synthase  46.9 
 
 		 312 aa  229  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000727024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  54.72 
 
 		 358 aa  229  8e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  46.75 
 
 		 305 aa  225  8e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15190  porphobilinogen deaminase  45.07 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.229707  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0845  porphobilinogen deaminase  45.35 
 
 		 312 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.026448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0618  porphobilinogen deaminase  52.65 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0490105 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  40.41 
 
 		 311 aa  220  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0066  porphobilinogen deaminase  45.05 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0447079  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2489  porphobilinogen deaminase  48.12 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100869 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  42.31 
 
 		 310 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  40.53 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  40.84 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  43.41 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4012  porphobilinogen deaminase  51.7 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  normal  0.94998 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  43.41 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3437  porphobilinogen deaminase  50.68 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000351099  decreased coverage  0.00118997 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  43.41 
 
 		 314 aa  209  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2767  porphobilinogen deaminase  51.25 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26790  hydroxymethylbilane synthase  44.09 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  42.51 
 
 		 300 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  39.35 
 
 		 310 aa  205  8e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  40.12 
 
 		 318 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  36.5 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3252  porphobilinogen deaminase  47.95 
 
 		 343 aa  204  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0180697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  41.07 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  37.54 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  39.53 
 
 		 318 aa  203  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  42.94 
 
 		 308 aa  203  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  44.67 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  38.44 
 
 		 313 aa  202  6e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  40.06 
 
 		 313 aa  202  9e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  38.94 
 
 		 318 aa  202  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  43.4 
 
 		 303 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  38.3 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  38.94 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  40.12 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  39.18 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  36.66 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  41.96 
 
 		 310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  38.87 
 
 		 309 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  37.09 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  38.17 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  38.17 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  38.87 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  38.17 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0767  porphobilinogen deaminase  37.28 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1688  porphobilinogen deaminase  36.31 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.814141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  37.87 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  38.15 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  37.97 
 
 		 313 aa  197  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  37.2 
 
 		 310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  37.98 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  37.69 
 
 		 309 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  37.87 
 
 		 309 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  38.99 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1422  porphobilinogen deaminase  36 
 
 		 291 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.168494  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0250  porphobilinogen deaminase  45.67 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  39.82 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  38.35 
 
 		 318 aa  192  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  41.32 
 
 		 313 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  35.5 
 
 		 310 aa  192  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  36.2 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  37.69 
 
 		 309 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2492  porphobilinogen deaminase  47.79 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0471431  normal  0.22632 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1385  porphobilinogen deaminase  36.2 
 
 		 307 aa  190  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0318  porphobilinogen deaminase  35.98 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0701  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.141584  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  41 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  39.27 
 
 		 314 aa  189  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1838  porphobilinogen deaminase  41.72 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  36.98 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  38.02 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  39.17 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0570  porphobilinogen deaminase  35.61 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0649  porphobilinogen deaminase  35.61 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.485602  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  41.62 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  38.94 
 
 		 326 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0354  porphobilinogen deaminase  35.13 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>