More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0262 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0262  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 303 aa  586  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.207863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0549  Hydroxymethylbilane synthase  74.59 
 
 		 306 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  0.484278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4439  porphobilinogen deaminase  64.36 
 
 		 311 aa  361  9e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4371  porphobilinogen deaminase  62.14 
 
 		 335 aa  342  5e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2732  porphobilinogen deaminase  61.69 
 
 		 320 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4579  porphobilinogen deaminase  56 
 
 		 312 aa  295  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8325  porphobilinogen deaminase  56.23 
 
 		 317 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0495  porphobilinogen deaminase  55.23 
 
 		 314 aa  281  9e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1014  porphobilinogen deaminase  53.27 
 
 		 313 aa  276  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0827893  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0357  porphobilinogen deaminase  52.9 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  56.98 
 
 		 358 aa  269  5e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0427  porphobilinogen deaminase  52.1 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.751162  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  52.94 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0668  porphobilinogen deaminase  52.43 
 
 		 318 aa  259  4e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6729  porphobilinogen deaminase  52.65 
 
 		 313 aa  258  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10521  porphobilinogen deaminase  53.11 
 
 		 309 aa  256  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02860  porphobilinogen deaminase  52.26 
 
 		 316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.302767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36050  hydroxymethylbilane synthase  50.32 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000727024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0618  porphobilinogen deaminase  57.63 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0490105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6130  porphobilinogen deaminase  49.4 
 
 		 354 aa  245  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0677  porphobilinogen deaminase  50.81 
 
 		 314 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0690  porphobilinogen deaminase  50.81 
 
 		 314 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  51.34 
 
 		 305 aa  245  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3252  porphobilinogen deaminase  52.88 
 
 		 343 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0180697  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0670  porphobilinogen deaminase  50.49 
 
 		 314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26790  hydroxymethylbilane synthase  47.43 
 
 		 337 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  44.37 
 
 		 318 aa  242  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  44.37 
 
 		 318 aa  242  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0066  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0447079  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0845  porphobilinogen deaminase  50.32 
 
 		 312 aa  237  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.026448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  41.45 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  41.72 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15190  porphobilinogen deaminase  47.4 
 
 		 377 aa  230  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.229707  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2767  porphobilinogen deaminase  50.68 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  47.16 
 
 		 309 aa  229  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  41.25 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2489  porphobilinogen deaminase  48.17 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  42.72 
 
 		 310 aa  225  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  43.05 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  44.04 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  41.97 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  42.05 
 
 		 318 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  42.05 
 
 		 318 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3437  porphobilinogen deaminase  51.62 
 
 		 342 aa  222  6e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000351099  decreased coverage  0.00118997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3530  porphobilinogen deaminase  46.82 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  43.33 
 
 		 309 aa  219  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2492  porphobilinogen deaminase  50.97 
 
 		 344 aa  219  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0471431  normal  0.22632 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  43.77 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  39.8 
 
 		 322 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0406  porphobilinogen deaminase  45.13 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  43.38 
 
 		 315 aa  216  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  41.64 
 
 		 317 aa  215  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  43.85 
 
 		 316 aa  215  9e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  46.34 
 
 		 315 aa  215  9e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2839  porphobilinogen deaminase  46.21 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  43.52 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0250  porphobilinogen deaminase  50.75 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  43.52 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0486  porphobilinogen deaminase  43.77 
 
 		 395 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.471298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  40.66 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  43.62 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  40.57 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1732  porphobilinogen deaminase  43.51 
 
 		 318 aa  212  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0335479  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  40.85 
 
 		 322 aa  212  7.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  43.29 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2786  porphobilinogen deaminase  43.25 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.50177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  42.9 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  43.33 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  43.83 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4145  porphobilinogen deaminase  41.81 
 
 		 309 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  41 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  41.61 
 
 		 311 aa  208  8e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  41.47 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4012  porphobilinogen deaminase  51.7 
 
 		 334 aa  208  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  normal  0.94998 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  41.79 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  42.14 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  42.67 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  43.29 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  37.09 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  43.29 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5394  porphobilinogen deaminase  43.18 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1838  porphobilinogen deaminase  45.67 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  41.83 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  44.59 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  43.51 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04137  porphobilinogen deaminase  44.63 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.870517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  41.95 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2170  porphobilinogen deaminase  39.06 
 
 		 307 aa  206  5e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  45.03 
 
 		 303 aa  206  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  39.53 
 
 		 320 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1936  porphobilinogen deaminase  47.94 
 
 		 308 aa  206  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0833928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  39.53 
 
 		 320 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  42.67 
 
 		 314 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  38.36 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  42.67 
 
 		 314 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  44.48 
 
 		 313 aa  205  8e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  42.24 
 
 		 313 aa  205  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  42.72 
 
 		 351 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  37.62 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  44.3 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>