More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24400 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  100 
 
 		 358 aa  685    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4371  porphobilinogen deaminase  60.85 
 
 		 335 aa  278  9e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15190  porphobilinogen deaminase  52.07 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.229707  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4439  porphobilinogen deaminase  62.96 
 
 		 311 aa  272  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0549  Hydroxymethylbilane synthase  59.25 
 
 		 306 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  0.484278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2732  porphobilinogen deaminase  59.77 
 
 		 320 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0262  porphobilinogen deaminase  56.98 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.207863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6729  porphobilinogen deaminase  58.7 
 
 		 313 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0495  porphobilinogen deaminase  63.01 
 
 		 314 aa  260  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4579  porphobilinogen deaminase  56.18 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  57.36 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02860  porphobilinogen deaminase  53.96 
 
 		 316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.302767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0677  porphobilinogen deaminase  59.09 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0690  porphobilinogen deaminase  59.09 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0670  porphobilinogen deaminase  58.68 
 
 		 314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0668  porphobilinogen deaminase  59.92 
 
 		 318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0618  porphobilinogen deaminase  65.98 
 
 		 326 aa  252  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0490105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8325  porphobilinogen deaminase  56.51 
 
 		 317 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10521  porphobilinogen deaminase  58.02 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3252  porphobilinogen deaminase  54.19 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0180697  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1014  porphobilinogen deaminase  57.85 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0827893  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3437  porphobilinogen deaminase  57.71 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000351099  decreased coverage  0.00118997 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26790  hydroxymethylbilane synthase  58.5 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0357  porphobilinogen deaminase  60.41 
 
 		 322 aa  242  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0427  porphobilinogen deaminase  60.41 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.751162  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0845  porphobilinogen deaminase  57.79 
 
 		 312 aa  239  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.026448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2492  porphobilinogen deaminase  56.25 
 
 		 344 aa  236  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0471431  normal  0.22632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0066  porphobilinogen deaminase  55.92 
 
 		 312 aa  236  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0447079  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4012  porphobilinogen deaminase  58.96 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  normal  0.94998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  51.15 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  46.32 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  54.25 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  48.36 
 
 		 310 aa  233  6e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  47.58 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  44.72 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  46.29 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  47.21 
 
 		 309 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2489  porphobilinogen deaminase  53.12 
 
 		 332 aa  229  6e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100869 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  45.94 
 
 		 312 aa  229  8e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  46.52 
 
 		 309 aa  228  9e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6130  porphobilinogen deaminase  54.72 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  48.04 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  45.26 
 
 		 314 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  45.36 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  50.75 
 
 		 313 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  45.52 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  43.87 
 
 		 351 aa  226  6e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  47.39 
 
 		 315 aa  225  9e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2767  porphobilinogen deaminase  52.08 
 
 		 332 aa  225  9e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  48.26 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  46.82 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  44.49 
 
 		 285 aa  223  4e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  49.39 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  46.79 
 
 		 317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  47.21 
 
 		 313 aa  223  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  46.3 
 
 		 312 aa  222  6e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  46.1 
 
 		 317 aa  222  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  49.63 
 
 		 314 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  49.63 
 
 		 314 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  48.31 
 
 		 315 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  46.44 
 
 		 310 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  46.44 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  46.44 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  46.44 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  43.49 
 
 		 318 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  48.51 
 
 		 314 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  49.06 
 
 		 320 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  49.06 
 
 		 320 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  44.81 
 
 		 321 aa  219  6e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  49.06 
 
 		 313 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  49.06 
 
 		 313 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  49.06 
 
 		 318 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  48.34 
 
 		 311 aa  219  7e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  47.96 
 
 		 322 aa  219  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  46.59 
 
 		 300 aa  218  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0486  porphobilinogen deaminase  52.36 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.471298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36050  hydroxymethylbilane synthase  52.77 
 
 		 312 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000727024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  46.44 
 
 		 310 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  46.44 
 
 		 310 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  46.44 
 
 		 310 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  44.28 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  46.44 
 
 		 310 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  43.82 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  45.35 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  46.13 
 
 		 318 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  45.62 
 
 		 326 aa  216  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  46.13 
 
 		 320 aa  216  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  46.13 
 
 		 320 aa  216  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  42.86 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  46.13 
 
 		 320 aa  216  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  46.13 
 
 		 313 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  46.13 
 
 		 313 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  44.33 
 
 		 309 aa  216  5.9999999999999996e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  45.35 
 
 		 313 aa  216  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  45.35 
 
 		 313 aa  216  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  46.13 
 
 		 318 aa  216  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  40.98 
 
 		 326 aa  215  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  46.13 
 
 		 320 aa  215  8e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  50.93 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04137  porphobilinogen deaminase  45.68 
 
 		 304 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.870517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>